プラグインがきちんと Plugins フォルダの中に入っていますか？ プラグインの検索は Plugins の更に 2階層下までです。 たとえば \Plugins\foo\bar\ は検索しますが、\Plugins\foo\bar\baz\ は検索しません。 詳しくはこちらをご覧になってください。 まずありえないとは思いますが、認識するプラグインの数の上限は 64 個です。 それ以上のプラグインがある場合は数を減らして下さい。