Organizovana nastava hemije u Srbiji prvi put se pominje u nastavnom planu Prirodno-tehnickog odeljenja Liceja. Razvoj ovog predmeta u kasnijim fazama sledi razvojni put ostalih prirodnih nauka.
Sredinom pedesetih godina XIX veka osniva se prva Hemijska laboratorija.
U razdoblju od 1863. do 1873. godine hemija se izucava na Tehnickom fakultetu Velike skole, a nastava je obavezna i za studente Filozofskog fakulteta.
Od 1873. godine nastava hemije vraca se, skupa sa ostalim prirodnim naukama, na Filozofski fakultet i tu se odvija sve do prerastanja Prirodno-matematickog odseka Filozofskog fakuletta u Prirodno-matematicki fakultet, 1947. godine.
Od 1973. godine na Prirodno-matematickom fakultetu organizovan je Odsek za hemijske i fizicko-hemijske nauke, sa poslovnom i organizacionom samostalnoscu.
Svojstvo samostalnog fakulteta, sa sopstvenim organima upravljanja, Hemijski fakultet stekao je 1995. godine, konstituisanjem prvog fakultetskog saveta i donosenjem Statuta Hemijskog fakulteta.
Od osnivanja do danas na ovom fakultetu diplomirala su 2484 studenta, Fakultet je dao 269 magistara i 176 doktora nauka.
Cetiri profesora ovog fakulteta su clanovi Srpske akademije nauka i umetnosti.