MODALITA' DI BASE. Questa modalità funziona con una configurazione per default in molti dei suoi aspetti. Permette inoltre di variare le opzioni più comuni dell'analisi. Per analizzare da questa modalità di funzionamento si deve scegliere una delle analisi predefinite già presenti nel programma visto che non è possibile crearne di personalizzate.
MODALITA AVANZATA. Questa modalità permette la configurazione di ognuna delle opzioni dell'analisi di Panda Antivirus 6.0. Inoltre, da questa modalità é possibile creare nuove analisi.