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Text File  |  1999-06-07  |  2.5 KB  |  37 lines
  1. FIGURE 8.1-1. Genetics of  cancer-associated retroviruses. (A) Reverse
  2. transcription. Reverse transcriptase cannot initiate polymerization de
  3. novo [ref:  21] and primes off  a parasitized host-cell tRNA  bound to
  4. cognate nucleotides  at the terminus  of U5. From there,  synthesis of
  5. minus strand DNA  proceeds to the 5'  end of the genomic  RNA, forming
  6. the "strong-stop"  cDNA (step  1). The RNA  portion of  the duplex  is
  7. degraded and  the strong-stop cDNA  strand then transfers (step  2) to
  8. the homologous R region at  the 3' end of the RNA (the  "first jump");
  9. negative strand cDNA synthesis again proceeds in the same direction to
  10. generate  a single-stranded  DNA  molecule  terminating  at  the  tRNA
  11. primer-binding site (step  3). Coincident with further  degradation of
  12. the  genomic RNA, a  second priming event  is initiated (step  4) at a
  13. string  of  purine RNA  residues (the  polypurine tract)  located just
  14. upstream of  U3 in  the virion  RNA to  allow synthesis  of a  second,
  15. positive strand DNA  molecule encompassing the full downstream  LTR. A
  16. second  strand  transfer  (step  5)  then  permits  synthesis  of  the
  17. full-length    double    stranded    DNA    (step    6).    LTRs    of
  18. replication-competent retroviruses enclose three canonical genes: gag,
  19. pol,  and env. In general, gag (group  specific antigen) codes for the
  20. internal core proteins, while pol encodes enzymes that include reverse
  21. transcriptase and integrase. Both gag  and pol are translated from the
  22. full-length genomic RNA;  env is translated from a  singly spliced RNA
  23. and  encodes the  surface  glycoprotein that  permits  viral entry  by
  24. binding  to species and  cell lineage-specific surface  receptors. The
  25. complex retroviruses  such as  the HTLVs  and the lentiviruses  (e.g.,
  26. SIV, HIV-1  and HIV-2,  feline immunodeficiency  virus, visna,  maedi,
  27. caprine  arthritis-encephalitis virus,  and  equine infectious  anemia
  28. virus) encode  additional  viral regulatory  and  accessory  proteins.
  29. These  viruses  generate  proportionately more  complex  ensembles  of
  30. spliced mRNAs.  [ref: 16]  (B) Rous sarcoma  virus and  simian sarcoma
  31. virus.  The former is replication-competent, the latter has sacrificed
  32. coding sequences to the insertion. (C) Avian leukemia  virus. Promoter
  33. insertion   is  illustrated.  (D)  Genomic  structures  of  the  human
  34. retroviruses  HIV-1  and HTLV-I.  (E)  A retroviral  vector,  LNL6 18.
  35. microCuries,    psi    or    packaging    signal.    NeoR,    neomycin
  36. phosphotransferase II gene.
  37.