home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Usenet 1994 January / usenetsourcesnewsgroupsinfomagicjanuary1994.iso / answers / biology / guide / part1 next >
Text File  |  1993-11-11  |  12KB  |  264 lines

  1. Newsgroups: sci.bio,sci.answers,news.answers
  2. Path: senator-bedfellow.mit.edu!bloom-beacon.mit.edu!news.kei.com!sol.ctr.columbia.edu!destroyer!gumby!yale!yale.edu!news.yale.edu!minerva!una
  3. From: Una Smith <una@minerva.cis.yale.edu>
  4. Subject: A Biologist's Guide to Internet Resources (1 of 6)
  5. Message-ID: <1993Nov11.013819.4203@news.yale.edu>
  6. Followup-To: poster
  7. Summary: Newsgroups, mailing lists, free data and software sources, and more.
  8. Originator: una@minerva
  9. Keywords: Internet archives biology ecology geology marine medical molecular
  10. Sender: news@news.yale.edu (USENET News System)
  11. Supersedes: <1993Aug24.010133.5737@news.yale.edu>,<1993Aug24.011303.6216@news.yale.edu>,<1993Aug24.011443.6352@news.yale.edu>,<1993Aug24.011739.6536@news.yale.edu>,<1993Aug24.011907.6609@news.yale.edu>,<1993Aug24.012337.6814@news.yale.edu>
  12. Nntp-Posting-Host: minerva.cis.yale.edu
  13. Reply-To: Una Smith <smith-una@yale.edu>
  14. Organization: Yale University
  15. Date: Thu, 11 Nov 1993 01:38:19 GMT
  16. Approved: news-answers-request@MIT.Edu
  17. Expires: 1 February 1994 
  18. Lines: 243
  19. Xref: senator-bedfellow.mit.edu sci.bio:15732 sci.answers:622 news.answers:14499
  20.  
  21. Archive-name: biology/guide/part1
  22. Last-modified: 10 November 1993
  23.  
  24.  
  25.         A Biologist's Guide to Internet Resources
  26.                    Version 1.7, 10 November 1993
  27.  
  28.               Copyright 1993 by Una R. Smith
  29.                              ISSN: 1071-9857
  30.  
  31.  
  32.         Una Smith            smith-una@yale.edu
  33.  
  34.     Yale University, Department of Biology, Osborn Memorial Laboratories,
  35.     PO Box 6666, New Haven, Connecticut  06511-8155  USA
  36.  
  37.  
  38. -*- Contents
  39.  
  40.  |  1. Introduction
  41. ||      1  What's New
  42. ||      2. Conditions of Use
  43. ||      3. How to Get the Latest Version 
  44.  |      4. Some Mind-Boggling Statistics
  45.  
  46.     2. Networking                    (part 2 of 6)
  47.         1. Netiquette
  48.         2. Usenet
  49.  |          1. Newsgroups of Special Interest
  50.  |          2. Special Usenet Hierarchies and Gated Mailing Lists
  51. ||          3. Usenet FAQs about Usenet
  52. ||          4. Usenet by E-mail
  53.         3. Mailing Lists Using LISTSERV
  54.             1. Commands
  55.             2. Archives
  56.  |          3. Gateways to Usenet
  57.  |      4. Other Mailing Lists
  58.         5. Newsletters
  59.  
  60.     3. Biological Research Archives            (part 3 of 6)
  61.  |      1. Bibliographies
  62.         2. Directories
  63.         3. Software
  64.         4. Data
  65.             1. Systematic Databases
  66.  |          2. Search Engines
  67.  |      5. List of Archives
  68.         6. Access Tools
  69.             1. Telnet 
  70.             2. Anonymous FTP
  71.             3. Anonymous FTP by E-mail
  72.             4. Gopher
  73.             5. Archie
  74.             6. Veronica
  75.             7. Wide-Area Information Servers (WAIS)
  76.             8. World-Wide Web (WWW)
  77.  
  78.     4. Useful and Important FAQs            (part 4 of 6 begins)
  79.         1. What's an FAQ and where can I get one?
  80.         2. Does anyone have an e-mail address for X?
  81.         3. How do I find a good graduate program?
  82.         4. Where can I get old newsgroup/mailing list articles?
  83. ||      5. Where can I find biology-related job announcements?
  84.  
  85.     5. Commercial Services
  86.  
  87.  |  Acknowledgements
  88.  
  89.  |  Bibliography                    (part 5 of 6)
  90.  
  91. ||  Appendix. Assorted Mailing Lists Using LISTSERV    (part 6 of 6)
  92.  
  93.  |  Note:  | indicates changes or new items, || indicates important changes.
  94.  
  95.  
  96. -*- 1. Introduction
  97.  
  98.  |  Due to its large and steadily increasing size, this guide has been split
  99.  |  into 6 parts for distribution via the Internet.  Each part is fairly 
  100.  |  independent of the others, and can be obtained separately, if desired.
  101.  |  However, this guide was written as a single document, and is most useful
  102.  |  when complete.
  103.  
  104.     If you find this guide difficult to understand, you might want to read
  105.     one of the published Internet guidebooks listed in the bibliography and
  106.     mentioned several times in this guide.  In the interest of brevity, no 
  107.     information that is easily obtained elsewhere is duplicated here in any
  108.     detail, thus, for a full understanding of the resources and tools listed
  109.     here, it is helpful to read the cited material as well.  To get started,
  110.     check the table of contents for interesting parts, and skim through the
  111.     whole document to get an idea of the scope and layout of what it covers. 
  112.  
  113.  
  114. -*- 1.1. What's New
  115.  
  116. ||  This guide has been assigned an ISSN by the United States Library of
  117.  |  Congress.  Note to Usenet FAQ maintainers:  it is classified as a serial
  118.  |  because it is distributed  periodically to e-mail subscribers and Usenet
  119.  |  readers.  Due to evident confusion among some US readers over the lack
  120.  |  of a copyright notice, I have given in and added one.  A notice has not
  121.  |  been required by US law since the US signed the Berne Convention several
  122.  |  years ago, but some readers incorrectly assume that because the guide had
  123.  I  no explicit copyright statement, it is in the public domain.  This is
  124.  |  not and never has been the case.  Rest assured, all previous versions of
  125. ||  the guide were (and still are) copyrighted.  The conditions-of-use
  126. ||  statement continues to change as readers to think of new ways to use the
  127.  |  guide that I did not anticipate.  Please bear with me.
  128.  
  129. ||  The procedure for e-mail subscriptions to the bionet.* newsgroups (via
  130. ||  BIOSCI) has changed significantly for some people.  See section 2.2.2.
  131.     
  132.  |  The appendix lists many new electronic mailing lists.  Environmental
  133.  |  policy and technology transfer lists have been separated out from
  134.  |  conservation biology and environmental studies.
  135.  
  136.  |  Just a reminder:  Internet computer names in the United Kingdom (JANET)
  137.  |  are written in the reverse of the order used everywhere else.  All e-mail
  138.  |  addresses listed in this guide that are at JANET sites are written in the
  139.  |  usual Internet style, with the top-level domain name last.  Thus to the
  140.  |  Internet world, MAILBASE-style mailing lists are hosted on mailbase.ac.uk,
  141.  |  but to JANET users the address is ...@uk.ac.mailbase.  Got that?
  142.  
  143.  |  A nifty way to find out what else is new in this version is to check
  144.  |  the acknowledgement section, where my many helpful correspondents are
  145.  |  thanked for their input.  I could not keep up with all the new Internet
  146.  |  resources without them!  To facilitate identifying new items in the
  147.  |  text, I will try to remember to add vertical bars in the left margin.
  148.  
  149.  |  (like this!)
  150.  
  151.  
  152. -*- 1.2. Conditions of Use
  153.  
  154. ||  This guide is intended for use as a handout for training in seminars,
  155. ||  workshops, and user services supporting use of the Internet by biologists,
  156. ||  and for personal use.  This guide may be freely distributed in parts or
  157. ||  concatenated, with the e-mail and/or Usenet headers and ending signature
  158. ||  removed.  The file format may be changed in any way that is convenient for
  159. ||  presentation.  Internet archive keepers:  please use a gopher link to the
  160. ||  official copy on sunsite.unc.edu (see the following section) or, if you
  161. ||  wish to maintain your own copy, use the correct title and make an effort
  162. ||  to keep your copy up to date.
  163.  
  164. ||  This guide may be adapted, within the limits of fair use, provided that
  165. ||  a citation is given.  Single copies of any document citing this guide
  166. ||  would be much appreciated!  The suggested citation is:
  167.  
  168. ||    Smith, Una R. (1993) A Biologist's Guide to Internet Resources.
  169. ||    Usenet sci.answers.  Available via gopher, anonymous FTP and e-mail
  170. ||    from various archives.  For a free copy via e-mail, send the text
  171. ||    "send pub/usenet/sci.answers/biology/guide/*" to the e-mail address
  172. ||    mail-server@rtfm.mit.edu.  ~45 pages.
  173.  
  174. ||  Any questionable use should be discussed in advance with the author.
  175. ||  This guide may not be sold for profit, in either the original or an
  176. ||  adapted form, without permission from the author. 
  177.  
  178.     Virtually every service or resource mentioned in this guide (and this
  179.     guide itself) is the un-paid, voluntary contribution of scientists and
  180.     students, both graduate and undergraduate.  Please give credit where due. 
  181.     If you make significant use of any document, data or software provided
  182.     via the Internet, the authors would be grateful if you would cite them
  183.     or otherwise acknowledge their efforts.  You may want to acknowledge the
  184.     administrators of archives from which you obtain data, software, or other
  185.     material;  contact the administrator to ask about the prefered citation.
  186.  
  187.     Every attempt is made to keep the information in this guide up-to-date
  188.     and correct.  Your assistance is greatly appreciated!  Before reporting
  189.     an error or omission, please be sure that you have the latest version. 
  190.     Thank you!
  191.  
  192.  
  193. -*- 1.3. How to Get the Latest Version
  194.  
  195.     This guide is updated more-or-less monthly.  The most current version
  196.     is available via Usenet, gopher, anonymous FTP and e-mail.  Please do
  197.     not ask the author to send you a copy, nor refer others to the author.
  198.  
  199.     - In Usenet, look in sci.bio or sci.answers.
  200.  
  201.     - Gopher to sunsite.unc.edu, and choose this sequence of menu items:
  202.  
  203.         Sunsite Archives
  204.             Ecology and Evolution
  205.  
  206.       Or, from any gopher offering other biology gophers by topic, look for
  207.       the menu item "Ecology and Evolution [at UNC and Yale]".  The guide is
  208.       stored there in two ways:  as a file for easy retrieval and as a menu
  209.       for browsing.
  210.  
  211.     - FTP to rtfm.mit.edu.  Give the username "anonymous" and your e-mail
  212.       address as the password.  Use the "cd" command to go to the directory
  213.  
  214.   |        pub/usenet/news.answers/biology/guide/
  215.  
  216.   |   and use "prompt" and "mget *" to copy all 6 parts of the guide to your
  217.       computer.  For information about how to get many other useful documents
  218.       from this archive, send the message "help".
  219.  
  220.       You can also use anonymous FTP to sunsite.unc.edu, where this guide is
  221.       stored as
  222.         pub/academic/biology/ecology+evolution/FAQ
  223.  
  224.     - Send e-mail to mail-server@rtfm.mit.edu with the text
  225.       
  226.   |        send usenet/news.answers/biology/guide/*
  227.  
  228.   |   You will receive 6 files in response, one for each part:  save each part
  229.       separately, delete the e-mail headers and footers, and merge them.
  230.  
  231.  
  232.     See section 3.6, Access Tools, for more information about retrieving
  233.     information from the Internet.
  234.  
  235.  
  236. -*- 1.4. Some Mind-Boggling Statistics
  237.  
  238.  |  Recently, approximately 37,000 articles per day were copied worldwide
  239.  |  through Usenet (Reid 1993b).  This traffic constituted 77 megabytes (or
  240.  |  30,000 printed pages) per day of announcements, questions and answers,
  241.  |  advice and bits of program code, references, heated debates, and raw data.
  242.  |  This is only a small fraction of the information added to the Internet in
  243.  |  that same time.  There are now over two million registered computers on
  244.  |  the Internet, according to the October 1993 Internet Domain Survey, and
  245.  |  thus tens of millions of people.  An estimated 13.8 million people have
  246.  |  accounts on 120,000 computers carrying Usenet, and 4.1 million people read
  247.  |  Usenet news at least occasionally (Reid 1993b).  The fraction of people 
  248.  |  with access to Usenet news who actually read it is increasing rapidly,
  249.  |  from 26% in July to 30% in October 1993.  There are several thousand world-
  250.  |  wide Usenet newsgroups and many thousands more electronic mailing lists.
  251.  
  252.     It appears that there are on the order of 10,000 people who read Usenet
  253.     newsgroups relating to biology (Reid 1993a), and there may be that many
  254.     using mailing lists for topics in biology.  All together, there are
  255.  |  one hundred newsgroups and 250 mailing lists that may be of particular
  256.     interest to biologists.  They are listed in section 2, Networking, and
  257.     the appendix, Assorted Mailing Lists Using LISTSERV.
  258.  
  259. -- 
  260.     Una Smith
  261.  
  262. Yale University, Department of Biology, Osborn Memorial Laboratories,
  263. PO Box 6666, New Haven, Connecticut  06511-8155     smith-una@yale.edu
  264.