Det medeltida Dorpat grundades 1224 sedan Tyska orden erövrat den gamla estniska handels-bosättning som fanns på platsen. Dorpat blev biskopssäte och var i slutet på 1200-talet den östligaste av alla hansastäder. Härifrån utgick handelsleder till Novgorod och staden blomstrade från 1300-talet till mitten av 1500-talet som ett centrum mellan öst och väst. Den medeltida staden, som byggdes på med nya lager från 1700-talet, har varit föremål för intensivt arkeologiskt arbete.