home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Multimedia Magazine 7 / Multimedia-No7-11-1995.iso / APPLICAT / HOME / BIOPAF / TUTOR3.TXT < prev    next >
Text File  |  1994-05-24  |  47KB  |  1,077 lines
  1.  
  2. Tutorial for BIOEDIT text editor part 1
  3.  
  4. Tutorial for BIOEDIT text editor part 1
  5.  
  6.  
  7. Tutorial for BIOEDIT text editor
  8.  
  9. BIOEDIT is a menu-driven editor with multiple text editing windows and
  10. context- sensitive 'Help' windows. It may be used with a mouse connected to a
  11. serial port of your PC, but this is not essential as the menus may be
  12. accessed by holding down the Alt key and pressing one of the 'hot' keys
  13. indicated at the top of the screen. These drop-down menus operate in a manner
  14. that is rapidly becoming the standard for modern software.
  15.  
  16. BIOEDIT will normally be executed automatically from Biographer, but if you
  17. want to go through this tutorial without running Biographer, you should
  18. simply enter BIOEDIT while you are in the directory where you have installed
  19. the Biographer files. You will see that BIOEDIT features five drop-down menus
  20. whose headings appear at the top of the screen, together with a display of
  21. the current time in digital form.
  22.  
  23. The following illustration shows the heading for the drop-down menus in the
  24. top row with the current time (in 24 hour digital clock form) at top right.
  25. There is a 'status line' on the bottom row of the screen and a new (empty)
  26. window labelled Untitled. If you have not launched BIOEDIT from Biographer,
  27. then you will only have the top and bottom rows on your screen. The new
  28. window is illustrated in order to explain some of the controls that you can
  29. operate if you have a mouse.
  30.  
  31.  
  32.   File   Edit   Search   Window   Utilities                          18:58:52
  33. ╔═[■]══════════════════════════════ Untitled ═══════════════════════════[]═╗
  34. ║_                                                                          
  35. ║                                                                           ░
  36. ║                                                                           ░
  37. ║                                                                           ░
  38. ║                                                                           ░
  39. ║                                                                           ░
  40. ║                                                                           ░
  41. ║                                                                           ░
  42. ║                                                                           ░
  43. ║                                                                           ░
  44. ║                                                                           ░
  45. ║                                                                           ░
  46. ║                                                                           ░
  47. ║                                                                           ░
  48. ║                                                                           ░
  49. ║                                                                           ░
  50. ║                                                                           ░
  51. ║                                                                           ░
  52. ║                                                                           ░
  53. ║ These  digits indicate the row:column of the cursor                      
  54. ╚══════ 1:1═══════░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░░─┘
  55. F1 Help  F2 Find Again  F3 Save  F4 Open  F5 Next  F8 Close  F9 Menu F10 Quit
  56.  
  57.  
  58. In the bottom 'Status line' the bold Function key codes have 'active' status,
  59. meaning that they are functional as soon as the program is launched. The grey
  60. text indicates that those Function keys are 'inactive' initially. When
  61. activated they will appear like the other text in the Status line.
  62.  
  63.  
  64. If you have a mouse, you can move this window around with a 'dragging'
  65. operation and close it by clicking on its Close icon [■].
  66.  
  67. You can zoom by clicking on the [] icon.
  68.  
  69. A window nay be resized by holding the button down and dragging the bottom
  70. right corner ─┘
  71.  
  72. You can move horizontally and vertically inside the window by using the
  73. scroll bars in the usual way.
  74.  
  75.  
  76. Tutorial for BIOEDIT text editor part 2
  77.  
  78. Tutorial for BIOEDIT text editor part 2
  79.  
  80.  
  81. The context-sensitive Help system is always active and you should get to know
  82. it immediately.
  83.  
  84. When first launched, none of the Menus is highlighted, so there is no context
  85. in which to offer help. Instead, if you press F1 you will get a general
  86. purpose introduction to BioEdit.
  87.  
  88.  
  89. The File menu is dropped down by holding down the Alt key and pressing F.
  90. Alternatively, if a mouse is connected you may use it to move the cursor
  91. anywhere on the heading File and then click its button to cause the File menu
  92. to drop down. Each menu heading has sub-headings as follows:
  93.  
  94.  
  95.  
  96. File              Edit            Search        Window       Utilities
  97.  New               Undo            Find...       Tile         Calendar
  98.  Open...       F4  --------------  Replace...    Overlap      ---------------
  99.  Save          F3  Cut    Ctrl+X   Find Again F2 Close All    Save desktop
  100.  Save As           Copy   Ctrl+C                 ---------    Retrieve dsktop
  101.  Print             Paste  Ctrl+V                 Size/Move    ---------------
  102.  -------------     Clear  Ctrl+B                 Zoom         Mouse...
  103.  Change directory  --------------                Next     F5  Palette...
  104.  Quit editor  F10  Show Clipboard                Previous     DOS shell
  105.                                                  Close    F8
  106.  
  107.  
  108. When a menu has been dropped down, a sub-heading is selected in a similar way
  109. to the main heading, except that the Alt key is not used. For example, when
  110. Search menu is first opened, the sub-heading Find will be highlighted. This
  111. highlight can be moved up and down using the arrow keys (say to place it on
  112. Replace...) and pressing Enter will activate the highlighted item. Another
  113. way to activate Replace... would be to press its 'hot' key R that is
  114. displayed in a contrasting colour in Replace...  A third method is to click
  115. the mouse on   Replace...
  116.  
  117.  
  118. The last main menu heading Utilities has an accessory of special interest to
  119. Family Historians, and so it will be described first, before the more general
  120. file handling and editing operations that are activated from the other main
  121. headings.
  122.  
  123. Make the Utilities menu drop down either by clicking on it or using Alt+U.
  124. The menu item Calendar will be highlighted, so it is the context for Help,
  125. which you can get by pressing F1.
  126.  
  127.  
  128. Tutorial for BIOEDIT text editor part 3
  129.  
  130. Tutorial for BIOEDIT text editor part 3
  131.  
  132.  
  133. When you have read the Help, press Esc or click on the [■] icon to close the
  134. Help window. The menu item Calendar will still be highlighted and you can
  135. either press Enter or click on the word Calendar to activate it. When
  136. Calendar is activated the current month and day are displayed in a fixed-size
  137. window as on the left below. The G.B. CALENDAR on the right shows the last
  138. month when it is necessary to use dual dating as the year 1751 began on 25
  139. March and ended on 31 December.
  140.  
  141.  
  142. ╔■═[■] G.B. CALENDAR ■═══╗Its controls are:        ╔■═[■] G.B. CALENDAR ■═══╗
  143. ║  OCTOBER  1993       ║                         ║  MARCH    1750/51    ║
  144. ║  Su Mo Tu We Th Fr Sa  ║Click or key  next month║  Su Mo Tu We Th Fr Sa  ║
  145. ║                  1  2  ║Click or key  prev month║                  1  2  ║
  146. ║   3  4  5  6  7  8  9  ║PgUp for next year       ║   3  4  5  6  7  8  9  ║
  147. ║  10 11 12 13 14 15 16  ║PgDn for previous year   ║  10 11 12 13 14 15 16  ║
  148. ║  17 18 19 20 21 22 23  ║Ctrl+PgUp forwrd 10 years║  17 18 19 20 21 22 23  ║
  149. ║  24 25 26 27 28 29 30  ║Ctrl+PgDn back ten years ║  24 25 26 27 28 29 30  ║
  150. ║  31                    ║Click[■]or key F8 toClose║  31                    ║
  151. ╚════════════════════════╝                         ╚════════════════════════╝
  152.  
  153. Easter Day is highlighted from 1700 onwards
  154.  
  155. Calendar Exercise
  156.  
  157. Open the Calendar. The quickest key sequence is Alt+U followed by C. The
  158. current month and year will be displayed and the date will be highlighted.
  159. Move from today to the 1891 Census in U.K. that was held on 5 April. Check
  160. that (as always) the census was held on a Sunday. You should also look at
  161. September 1752 and see what happened when Great Britain adopted the New Style
  162. (Gregorian) Calendar. Then move back to APRIL 1751 and notice that only one
  163. year appears in the title and that Easter Day (7) is highlighted. Move back
  164. one month and you have the above Calendar for the last occasion when the
  165. British year ended on 24 MARCH.
  166.  
  167. Before you close the Calendar, use the key sequence Alt+U followed by S to
  168. Save desktop. This will store a copy of the current screen display that you
  169. can retrieve at any time. Now click on [■] or press F8 to close the Calendar.
  170. Do not do it now, but if you did open the Calendar as before using Alt+U
  171. followed by C then you will be back to the present day, not 1752 (or
  172. whatever). The quickest way to recall the last month you examined is to
  173. Retrieve desktop  by keying Alt+U followed by R.
  174.  
  175.  
  176. Tutorial for BIOEDIT text editor part 4
  177.  
  178. Tutorial for BIOEDIT text editor part 4
  179.  
  180.  
  181. ASCII Codes Exercise
  182.  
  183. Biographer is supplied with three data files:
  184.  
  185.       ASCII.BIO        COUNTIES.BIO            REGDIST.BIO
  186.  
  187. You should consult, and then copy from the file ASCII.BIO in order to enter
  188. the following text, which contains some of the more frequently-used
  189. characters from the extended IBM character set:
  190.  
  191.  
  192.         PLEASE NOTE THAT THE REST OF THIS EXERCISE (& SECTION OF
  193.         THIS PROGRAM) CAN BE FOUND IN THE FILE ASCII.DOC.
  194.  
  195.         THIS HAS BEEN NECESSARY BECAUSE SOME OF THE CHARACTERS
  196.         FROM THE EXTENDED ASCII CHARACTER SET THAT APPEAR ON
  197.         SCREEN INTERFERE WITH THE OPERATION OF THIS PROGRAM,
  198.         AS THEY ARE INTERPRETTED AS PROGRAM CODE.
  199.  
  200.         ASCII.DOC is a straightforward ASCII text file and maybe
  201.         viewed and printed in the normal way with your own word
  202.         processor or DOS commands.
  203.  
  204.  
  205. Quit BioEdit with F10 and have a rest if you need to.
  206.  
  207. You have completed about 40% of the tutorial - when you have finished
  208. the exercise in ASCII.DOC!
  209.  
  210.  
  211. Tutorial for BIOEDIT text editor part 5
  212.  
  213. Tutorial for BIOEDIT text editor part 5
  214.  
  215.  
  216. File Menu Exercise
  217.  
  218. Restart BioEdit either by entering BIOEDIT or (if you wish to look at, say,
  219. the ASCII.BIO file immediately) enter BIOEDIT ASCII.BIO
  220.  
  221. To open (another) existing file use F4 or sequence Alt+F followed by O.
  222.  
  223. A Prompt line and a list of files appears. Only files with the extension .BIO
  224. appear in the list. Press Tab to move from the editable text field that reads
  225. *.BIO to the list of files. You can move around this list of files with the
  226. arrow keys, or by clicking with the mouse. Full details of the currently
  227. highlighted file appear on the bottom two lines of the Open biograph file
  228. window. Highlight the REYNOLDS.BIO file (it was supplied on the disk sent
  229. with this Tutorial) and press Enter or click on the Open button to open it.
  230.  
  231.  
  232. N.B: The rest of this Section contains the following Biograph. The exercises
  233. resume in the next Section.
  234.  
  235.  
  236. Arthur Henry REYNOLDS (C0021)                       Prepared: Mon 18 Oct 1993
  237. ─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
  238. AGE        DATE                    EVENT             (± age based on baptism)
  239.   │Sun  6 Jul 1800│His maternal grandmother Harriett IMPETT was baptised at
  240.   │               │Stourmouth, KEN
  241.   │Sun 19 Dec 1802│His paternal grandfather Stephen REYNOLDS was baptised at
  242.   │               │Mersham, KEN
  243.   │Sun 14 May 1809│His paternal grandmother Maria HART baptised at Stowting
  244.   │               │KEN  1809 Maria Dr of Jonathan & Mary Ann Hart May? 14th
  245.   │Abt    Apr 1825│His maternal grandfather Thomas PETLEY married grandmother
  246.   │               │Harriett IMPETT at Hoath, KEN, Banns 27 Mar, 3 Apr, 10 Apr
  247.   │Mon  2 Apr 1832│His paternal grandfather Stephen REYNOLDS married
  248.   │               │grandmother Maria HART at St Mary, Stowting, KEN, Stephen
  249.   │               │Reynolds(of this parish) and Maria Hart(of this parish) in
  250.   │               │the presence of Jonathan Hart, Elizabeth Corey (all made
  251.   │               │their mark)
  252.   │Tue  5 Dec 1837│His mother Charlotte PETLEY was born at Blean, Hoath, KEN
  253.   │               │"4a.m." (twins or unfamiliarity of Civil Register?)
  254.   │Sun  4 Feb 1838│His mother Charlotte PETLEY was baptised at Hoath, KEN
  255.   │               │Father's occupation: Labourer
  256.   │Sat 29 Aug 1840│His father Stephen Frederick REYNOLDS was born at Gravel
  257.   │               │Castle, Barham, KEN
  258.   │Sat  3 Nov 1866│His father Stephen Frederick REYNOLDS married mother
  259.   │               │Charlotte PETLEY at Poplar, MDX, Banns published in Barham
  260.   │               │14 Oct 1866, 21 Oct 1866, 28 Oct 1866
  261.   │Sun 27 Oct 1867│His brother Frederick Kenneth REYNOLDS baptised at Barham
  262.   │               │ KEN  Father's occupation: Bricklayer
  263.   │Wed 13 Jan 1869│His brother William George REYNOLDS was born at Barham,KEN
  264.   │Sun  4 Apr 1869│His brother William George REYNOLDS was baptised at Barham
  265.   │               │KEN  Father's occupation: Bricklayer
  266.   │       Sep 1870│His sister Gertrude Harriet REYNOLDS born at Barham, KEN
  267.   │Sun 25 Dec 1870│His sister Gertrude Harriet REYNOLDS was baptised at
  268.   │               │Barham, KEN  Father's occupation: Labourer
  269.   │Sun 24 Mar 1872│His brother Edward John REYNOLDS was baptised at Barham,
  270.   │               │KEN  Father's occupation: Labourer
  271. ─────────────────────────────────────────────────────────────────────────────
  272.   │Sun 27 Jul 1873│He was born at Barham, KEN Birth Reg. Bridge 2a 669  Q3
  273.   │               │1873 (His parents were married 6 years 8 months before)
  274.   │Mon 22 Sep 1873│He was baptised at Barham, KEN Father's occupation: Labr.
  275.  2│Abt    Mar 1876│His brother George Albert REYNOLDS was born at  Barham,KEN
  276.  2│Sun 30 Apr 1876│His brother George Albert REYNOLDS was baptised at Barham,
  277.   │               │KEN  Father's occupation: Labourer
  278.  3│Sat 20 Jan 1877│His future spouse Fanny Louisa APPS was born at Bridge,KEN
  279.   │               │Birth Reg. Bridge 2a 783  Q1 1877
  280.  3│Sat 24 Feb 1877│His brother Charles Stephen REYNOLDS baptised at Barham,
  281.   │               │KEN  Father's occupation: Labourer
  282.   │        Undated│His brother George Albert REYNOLDS died at  Nail Bourne,
  283.   │               │Barham, KEN  (aged  2)
  284.   │        Undated│His brother George Albert REYNOLDS died (aged  3)
  285.  5│Sat 15 Mar 1879│His brother George Albert REYNOLDS funeral was held at
  286.   │               │Barham, KEN  By coroner's order, accidentally drowned.Age3
  287.  7│Abt        1881│His future 2nd spouse Ellen Agnes KENNEDY was born at  KEN
  288.  7│Aft        1881│His paternal grandmother Maria REYNOLDS (née HART) died at
  289.   │               │As she appears in the 1881 Census (aged 71)
  290.  7│Bef  3 Apr 1881│His paternal grandfather Stephen REYNOLDS died (aged 78)
  291.  7│Aft    May 1881│His brother Albert Ernest REYNOLDS was born
  292. 16│Sat  9 Nov 1889│His brother Frederick Thomas REYNOLDS married Ellen GATES
  293.   │               │at Barham, KEN , Frederick (23), Ellen (24)
  294. 17│Bef        1891│Occupation: Labourer Barham, KEN
  295. 17│Aft        1891│Occupation: Apprentice Bricklayer Bridge, KEN
  296. 19│           1893│Occupation: Bricklayer (Journeyman) Margate, KEN
  297. 19│Tue  7 Mar 1893│His sister Gertrude Harriet REYNOLDS married Robert HEATH
  298.   │               │at Barham, KEN , Widower married Spinster, witnessed by
  299.   │               │Arthur Reynolds-C0021
  300. 19│Sun 23 Jul 1893│He married Fanny Louisa APPS at St Peters', Bridge, KEN.
  301.   │               │1st child born 15 Sep 1893 (8 weeks later)
  302. 20│Fri 15 Sep 1893│His daughter Dorothy Jane REYNOLDS was born at Barham, KEN
  303. 20│Sun 29 Oct 1893│His daughter Dorothy Jane REYNOLDS was baptised at Barham,
  304.   │               │KEN  Father's occupation: Labourer
  305. 21│Fri 27 Jul 1894│He came of age
  306. 22│Sun 27 Oct 1895│His daughter Phyllis Marjory REYNOLDS was baptised at
  307.   │               │Barham, KEN
  308. 22│Abt        1896│His brother William George REYNOLDS married Mary Ann
  309.   │               │BENNETT at Barham, KEN
  310. 23│Sat  8 May 1897│His step-son Percy Donald KENNEDY was born at Margate, KEN
  311. 23│Sat 22 May 1897│His daughter Elsie Victoria REYNOLDS was born at Barham,
  312.   │               │KEN
  313. 25│Sun 30 Apr 1899│His son Arthur George REYNOLDS was baptised at Barham, KEN
  314.   │               │Father's occupation: Bricklayer
  315. 26│Tue  2 Jan 1900│His son Charles Albert REYNOLDS was born at Barham, KEN
  316.   │        Undated│His son Arthur George REYNOLDS died (aged  1)
  317. 26│Fri 13 Apr 1900│His son Arthur George REYNOLDS funeral was held at Barham,
  318.   │               │KEN    Age 16 months
  319. 28│       Oct 1901│His daughter Annie Elizabeth REYNOLDS was born at  Barham,
  320.   │               │KEN
  321. 31│Tue 10 Jan 1905│His step-son Percy Donald KENNEDY was baptised at St John,
  322.   │               │Thanet, KEN  No father given. Mother: Ellen Agnes KENNEDY
  323.   │               │(no occupation)
  324. 34│       Jan 1908│His father Stephen Frederick REYNOLDS died at Barham, KEN
  325.   │               │(aged 67)
  326. 34│Thu 19 Mar 1908│His father Stephen Frederick REYNOLDS funeral was held at
  327.   │               │Barham, KEN    Age 68
  328. 34│Mon 27 Apr 1908│His wife Fanny Louisa REYNOLDS (née APPS) died at Barham,
  329.   │               │KEN    T.B.  (aged 31)
  330. 34│Sun  3 May 1908│His wife Fanny Louisa REYNOLDS (née APPS) funeral was held
  331.   │               │at Barham, KEN    Age 31
  332. 35│Sat 24 Apr 1909│He marr. Ellen Agnes KENNEDY at Primitive Methodist Chapel
  333.   │               │Margate, KEN, 1st child born 24 Nov 1909 (7 months later)
  334. 36│Wed 24 Nov 1909│His son Sidney Arthur REYNOLDS was born at Margate, KEN
  335. 36│Mon 28 Mar 1910│His son Sidney Arthur REYNOLDS was baptised at St John,
  336.   │               │Thanet, KEN    Private Baptism
  337. 37│Thu 18 May 1911│His daughter Helen Agnes REYNOLDS was born at 94 Dane Road
  338.   │               │Margate, KEN
  339. 37│Fri 30 Jun 1911│His daughter Helen Agnes REYNOLDS was baptised at St John,
  340.   │               │Thanet, KEN    Father's occupation: Journeyman Bricklayer
  341. 42│Fri 20 Aug 1915│His granddaughter Rose PACKMAN was born at Wootton, KEN
  342. 42│Mon 11 Oct 1915│His daughter Dorothy Jane REYNOLDS married Ken
  343.   │               │PACKMAN at Barham, KEN   .  Ken aged 20; Dorothy aged 22.
  344. 43│Fri 30 Mar 1917│His son Charles Albert REYNOLDS died at Brompton Hospital,
  345.   │               │Chelsea, LND Tuberculosis (aged 17)
  346. 45│Abt        1919│His daughter Phyllis Marjory REYNOLDS married Don KENNEDY
  347.   │               │at Margate, KEN
  348. 46│Abt        1920│His grandson Peter KENNEDY was born
  349. 46│Thu 11 Mar 1920│His granddaughter Adana PACKMAN was born
  350. 47│       Apr 1921│His mother Charlotte REYNOLDS (née PETLEY) died at Barham,
  351.   │               │KEN (aged 83)
  352. 50│Sat 12 Jul 1924│His grandson Arthur Ken PACKMAN was born at Kingston, KEN
  353. 51│Thu 11 Sep 1924│His daughter Elsie Victoria REYNOLDS married Charles
  354.   │               │Thomas COOLEY at St John Baptist, Barham, KEN
  355. 55│Tue 19 Mar 1929│His granddaughter Jean Elsie COOLEY born at 61 St Johns
  356.   │               │Park, Tufnell,LCC Purchased when State Pension applied for
  357. 55│Sun 28 Apr 1929│His granddaughter Jean Elsie COOLEY was baptised at St
  358.   │               │John's, Upper Holloway, LCC Photocopy of original in her
  359.   │               │possession
  360. 60│Tue 24 Apr 1934│Silver Wedding Anniversary
  361. 63│       Jun 1937│His granddaughter Rose PACKMAN married William WOOD at
  362.   │               │Whitstable, KEN
  363. 64│Thu  3 Mar 1938│His grandson Peter COOLEY was born at Oakleigh Road, East
  364.   │               │Barnet, Hertfordshire
  365. 64│Sun  1 May 1938│His grandson Peter COOLEY was baptised at St John the
  366.   │               │Evangelist, Friern Barnet, MDX
  367. 68│Sat 14 Mar 1942│He died at General Hospital, Margate, KEN. Death
  368.   │               │Certificate: Angina
  369.  
  370.  
  371. Tutorial for BIOEDIT text editor part 6
  372.  
  373. Tutorial for BIOEDIT text editor part 6
  374.  
  375.  
  376. The first new menu item you are going to use is the Search command. Have a
  377. look around the file first, using the PgUp and PgDn keys. Notice that there
  378. are many places where the character string 'KEN' appears. When you have
  379. finished browsing use the arrow keys or the Page keys to move to the very
  380. beginning of the file. Use Alt+S followed by F and the following prompt will
  381. appear:
  382.  
  383. Text to find
  384.  
  385.  
  386. [ ] Case sensitive
  387. [ ] Whole words only
  388.  
  389.    OK         Cancel
  390.  
  391.  
  392. When no biograph files are open  you can still pull down the Search menu, but
  393. you will notice that the Find item is inactive. Make the Text to find:
  394.  
  395.       KEN
  396.  
  397. the County Code for Kent.
  398.  
  399. The problems with this particular County Code are that it is almost as long
  400. as the full name and it is also an abbreviation for Kenneth. Ultimately, you
  401. are going to change every occurrence of 'KEN' to 'Kent' but you do not wish
  402. to change the given name 'Ken' into 'Kent'. You can avoid this embarrassment
  403. by making the search Case sensitive. When you have typed (all uppercase) KEN
  404. press the Tab key and the cursor will move to the box before Case sensitive.
  405. Now press the Space Bar and X will appear in the box to indicate that the
  406. option is now selected. Press  and the cursor will move to the box
  407.  
  408. [_] Whole words only
  409.  
  410.  
  411. We do NOT wish to find the KEN in KENNEDY, so press the Space Bar and X will
  412. appear in the box to indicate that the option is selected.
  413.  
  414. The Find window should now look like this:
  415.  
  416. Text to find
  417. KEN
  418.  
  419. [X] Case sensitive
  420. [X] Whole words only
  421.  
  422.   OK         Cancel
  423.  
  424.  
  425. The OK box will be highlighted to indicate that it will be selected when you
  426. press Enter. So press Enter or click on the OK box and BioEdit will rapidly
  427. find the first occurrence of KEN in the line:
  428.  
  429.   │               │Stourmouth, KEN
  430.  
  431.  
  432. Press F2 to Find again and BioEdit will find KEN in the line:
  433.  
  434.   │               │Mersham, KEN
  435.  
  436.  
  437. You can keep pressing F2 to find other occurrences. Notice what happens after
  438. about twenty two presses of F2: the following line is found with KEN (the
  439. whole word, not as part of KENNEDY) highlighted.
  440.  
  441.  7│Abt        1881│His future 2nd spouse Ellen Agnes KENNEDY was born at KEN
  442.  
  443.  
  444. Notice also how KEN (and not Ken) is highlighted in this line:
  445.  
  446.   │               │PACKMAN at Barham, KEN.  Ken aged 20; Dorothy aged 22.
  447.  
  448.  
  449. So, let's tidy up all those messy KEN abbreviations by using the Replace item
  450. from the Search menu. Return to the top of the biograph and press Alt+S
  451. followed by R. Another type of text input window appears:
  452.  
  453. Text to find
  454. KEN
  455.  
  456. New text
  457. Kent
  458.  
  459. [X] Case sensitive
  460. [X] Whole words only
  461. [ ] Prompt on replace
  462. [X] Replace all
  463.  
  464.     OK         Cancel
  465.  
  466. You will need to take the appropriate action to set all the items shown in
  467. bold above. When you press Enter with the options set as shown, every time
  468. that BioEdit finds KEN (the whole word in uppercase) it will replace it with
  469. Kent, without asking you whether or not it should do so. The process is
  470. completely reliable and the biograph for this exercise has so many KEN
  471. strings that it is irritating to be asked about all of them. In other words,
  472. the Replace all option can safely be used for the sample biograph, but you
  473. should use this option with great care as it can produce some nasty
  474. surprises. For example, do not try changing all (accidental) occurrences of a
  475. double space by a single space. Biographs are generated with lots of
  476. consecutive spaces in them and automatic replacement will ruin the alignment
  477. of the biograph columns.
  478.  
  479. Save your modified biograph with a different name using the Save As menu
  480. (Alt+F then A). Call the modified version REYNOLD2.BIO. You can edit the line
  481. where the file name is displayed in the normal way with the arrow keys,
  482. backspace, delete, etc. You might like a rest at this point: if so Quit
  483. BioEdit by pressing F10. Otherwise, don't Quit, but go straight on to the
  484. next Exercise.
  485.  
  486.  
  487. Tutorial for BIOEDIT text editor part 7
  488.  
  489. Tutorial for BIOEDIT text editor part 7
  490.  
  491.  
  492. Exercise - Using the Edit menu
  493.  
  494. If you have just launched BioEdit then Open file REYNOLD2.BIO, otherwise it
  495. will still be on the desktop and you can now edit it directly. When you press
  496. Alt+E the drop-down part of the menu is revealed thus:
  497.  
  498.  Undo
  499.  --------------
  500.  Cut     Ctrl+X
  501.  Copy    Ctrl+C
  502.  Paste   Ctrl+V
  503.  Clear   Ctrl+B
  504.  --------------
  505.  Show clipboard
  506.  
  507.  
  508. We will first use the Cut, Copy, Paste and Clear functions. All of them can
  509. be operated without the need to drop down the menu; you do this by holding
  510. down a Ctrl key and pressing X, C, V or B. These keys are on the bottom row
  511. of the keyboard, next to each other and are the same key combinations used by
  512. many PC and Macintosh word-processors and editors to achieve the same result.
  513. All four will only operate on selected text, so let's select some: if you
  514. move down the biograph to 5 Dec 1837 there is a rather messy note on the next
  515. line. You can either search for 5 Dec 1837 visually, or use Alt+S followed by
  516. F to be prompted for what to find.
  517.  
  518. The messy line is:
  519.  
  520. (twins or unfamiliarity of Civil Register?)
  521.  
  522. Highlight everything in parenthesis by moving the cursor on to (  and then
  523. hold down a shift key and use  to highlight all of the above. Now Cut the
  524. highlighted text by holding down a Ctrl key and pressing X. The highlighted
  525. text disappears from the window, but it has actually been copied to a
  526. temporary storage place known as the Clipboard. If you would like to see
  527. what's on the clipboard at any stage you should press Alt+E followed by S. If
  528. you actually cut the above phrase then that is exactly what appears in the
  529. clipboard window:
  530.  
  531. (twins or unfamiliarity of Civil Register?)
  532.  
  533. It is very instructive (for this exercise, at least) to keep the clipboard
  534. window visible on the desktop while you work in the window labelled
  535. REYNOLD2.BIO. The easiest way to do this is by pressing Alt+W followed by T
  536. (tile). The Clipboard will take up one half of the desktop and REYNOLD2.BIO
  537. the other half.  You should find that the selected window is the bottom one,
  538. but if not, press F5 (Next) to change the active window. Obviously, if the
  539. Clipboard is NOT active then you cannot do anything with it, but BioEdit can.
  540. Move down two lines and highlight the phrase:
  541.  
  542. Father's occupation: Labourer
  543.  
  544. Now Cut this phrase, using the Ctrl+X keys. You should see that, almost
  545. simultaneously
  546.  
  547. Father's occupation: Labourer
  548.  
  549. disappears from the REYNOLD2.BIO window and reappears in the Clipboard
  550. window. So, when you are about to Paste some text, a glance at the Clipboard
  551. reminds you what you are pasting. Try that now. Leave the cursor where it is
  552. and press Ctrl+V.
  553.  
  554. Father's occupation: Labourer
  555.  
  556. will reappear in its original place, BUT a copy of that phrase is still in
  557. the Clipboard. Now move down seven lines and highlight the phrase:
  558.  
  559. Father's occupation: Bricklayer
  560.  
  561. This time, do not Cut the text, Copy it using Ctrl+C. The highlighting
  562. remains and the biograph is unchanged. However, notice that a copy of:
  563.  
  564. Father's occupation: Bricklayer
  565.  
  566. now appears in the Clipboard. There are two modes of pasting: overtype or
  567. insert. You have just done an insert, now try an overtype. Move up seven
  568. lines and highlight the phrase:
  569.  
  570. Father's occupation: Labourer
  571.  
  572. Now, when you press Ctrl+V you will see that the highlighted phrase has been
  573. replaced by a copy of the contents of the Clipboard and the highlighting has
  574. disappeared. This is one process that can be Undone. Press Alt+E followed by
  575. U and the phrase
  576.  
  577. Father's occupation: Labourer
  578.  
  579. will reappear. When Undo can be used it will appear normally in the Edit
  580. drop-down menu, otherwise it is 'greyed-out' and nothing will happen. The
  581. 'greyed-out' look is applied to Cut, Copy and Clear when nothing is
  582. highlighted. Paste is 'greyed-out' when the Clipboard is empty. You can empty
  583. the Clipboard by F5 (Next) to select the Clipboard window, and then simply
  584. press Delete to empty it. If you now press Alt+E you will see that Paste is
  585. 'greyed-out'.
  586.  
  587. The only Edit function you have not used is Clear. Highlight the phrase:
  588.  
  589. Father's occupation: Labourer
  590.  
  591. and then press Ctrl+B. The text disappears from the Biograph window BUT it
  592. does not appear in the Clipboard window, which remains unchanged.
  593.  
  594.  
  595. You have now seen for yourself that:
  596.  
  597. Cut         removes highlighted text and copies it to the clipboard
  598. Copy        does not remove highlighted text, but copies it to the clipboard
  599. Paste       overtypes or inserts the contents of the clipboard at the
  600.             highlighted area or at the cursor
  601. Clear       removes highlighted text and does not copy it to the clipboard
  602.  
  603.  
  604. Tutorial for BIOEDIT text editor part 8
  605.  
  606. Tutorial for BIOEDIT text editor part 8
  607.  
  608.  
  609. Now let's combine the Find operation with Cut and Paste. Return to the top of
  610. the Biograph and use Replace  to locate the date:
  611.  
  612. Mon 11 Oct 1915
  613.  
  614.  
  615. and replace it with:
  616.  
  617. Sun 11 Oct 1914        (Use the Calendar to check the day of the week)
  618.  
  619.  
  620. The only option you should set in the Replace window is
  621.  
  622. [X] Prompt on replace
  623.  
  624.  
  625. When you have done that the marriage is out of order in the biograph, so
  626. highlight the two lines that detail this marriage:
  627.  
  628. 42|Sun 11 Oct 1914|His daughter Dorothy Jane REYNOLDS married Ken
  629.   |               |PACKMAN at Barham, Kent.  Ken aged 20; Dorothy aged 22.
  630.  
  631.  
  632. and then Cut them using Ctrl+X. Check that what you wanted has been copied to
  633. the clipboard window. Move up one line and press Ctrl+V and the contents of
  634. the clipboard will be copied into the correct position in the biograph. The
  635. only thing now wrong is the age, so change it to 41 by putting the cursor on
  636. the 2 and then pressing the Insert key before you type 1. Notice that the
  637. cursor changes to a flashing rectangle (to indicate overtype) as a result of
  638. pressing Insert.
  639.  
  640. If you need a rest then press F10 and BioEdit will prompt you to save
  641. REYNOLD2.BIO which has been modified. Otherwise close that file with key
  642. sequence Alt+W followed by C and you will get a similar prompt.
  643.  
  644.  
  645. Tutorial for BIOEDIT text editor part 9
  646.  
  647. Tutorial for BIOEDIT text editor part 9
  648.  
  649.  
  650. Change Directory Exercise
  651.  
  652. Now let's look at how you might read in biograph files from other directories
  653. within your main directory. If you installed BioEdit from the disc provided
  654. then it is likely that you are currently accessing directory C:\PEDIGREE or
  655. C:\PAF. You will normally execute BioEdit from this directory by entering
  656. BIOEDIT.
  657.  
  658. If you use key sequence Alt+F followed by C, you are presented with a
  659. dialogue box like this:
  660.  
  661.  
  662.  ╔═[■]■═════════■Change Directory ■═════════════╗
  663.  ║                                              ║
  664.  ║  Directory name                              ║
  665.  ║   C:\PEDIGREE                                ║
  666.  ║                                              ║
  667.  ║  Directory tree                 ┌─────────┐  ║
  668.  ║   Drives                       │   OK    │  ║
  669.  ║   └─┬C:\                     ░  └─────────┘  ║
  670.  ║     └─┬PEDIGREE              ░  ┌─────────┐  ║
  671.  ║       └┬─FAMILY.PED          ░  │ Chdir   │  ║
  672.  ║        ├ RESEARCH.PED        ░  └─────────┘  ║
  673.  ║        ├ ROYALTY.PED         ░  ┌─────────┐  ║
  674.  ║        ├ IGI.PED             ░  │ Revert  │  ║
  675.  ║        └ OTHER.PED           ░  └─────────┘  ║
  676.  ║                                ┌─────────┐  ║
  677.  ║                                 │  Help   │  ║
  678.  ║                                 └─────────┘  ║
  679.  ╚══════════════════════════════════════════════╝
  680.  
  681. The Change Directory dialogue box consists of an input box (reads C:\PEDIGREE
  682. above), a list box, the standard OK and Help buttons, and two other buttons
  683. (Chdir and Revert).
  684.  
  685. The Directory Name input box is where you type in the path of the new
  686. directory. The Directory Tree list box enables you to navigate directories by
  687. using the selecting bar and pressing Enter. If you are using the keyboard,
  688. press Enter to make the selected directory be the current directory, then
  689. choose OK or press Esc to exit the dialogue box.
  690.  
  691.  ┌─────────┐
  692.  │  Chdir  │ The Chdir button changes the current directory once
  693.  └─────────┘ you've selected or typed in a directory name.
  694.  
  695.  ┌─────────┐
  696.  │  Revert │ The Revert button goes back to the previous directory
  697.  └─────────┘ as long as you have not yet exited the dialogue box.
  698.  
  699. Type in the path of your main directory (e.g. C:\PEDIGREE) and press Tab (not
  700. Enter). You should get a tree display something like the above example. Use
  701. the arrow keys to move the highlight on to your first sub-directory (shown
  702. as FAMILY.PED above). If you now press key C, or click on [ Chdir ], the
  703. tree diagram will change to indicate that, for example,
  704. C:\PEDIGREE\FAMILY.PED is the currently logged directory. Be careful not to
  705. hit Enter until you have visual confirmation of the change of directory,
  706. because Enter is equivalent to [ OK ] and simply closes the dialogue box
  707. without selecting the highlighted directory.
  708.  
  709. Now try opening some biograph files from the new directory you have just
  710. selected. The quickest way to bring up a list of files with extension .BIO
  711. is by pressing function key F4. The Open a File dialogue box contains an
  712. input box, a file list, a file information panel, a [ Cancel ]  button and an
  713. [ Open ] button , plus a history list that is attached to the Name input
  714. box:
  715.  
  716.  ┌─ Name ──────────────────────────┐
  717.  │                                 │
  718.  └─────────────────────────────────┘
  719. The Name input box is where you enter the name of the file to load, or the
  720. file-name mask to use as a filter for the Files list box (for example, *.*).
  721.  
  722.  ┌ Files ──────────────────────────┐
  723.  │                                 │
  724.  │  PIN0001.BIO   │  PIN0009.BIO   │    Files list box
  725.  │  PIN0002.BIO   │  PIN0010.BIO   │
  726.  │  PIN0003.BIO   │  PIN0011.BIO   │
  727.  │  PIN0004.BIO   │  PIN0012.BIO   │
  728.  │  PIN0005.BIO   │  ..            │
  729.  │  PIN0006.BIO   │  \LETTERS      │
  730.  │  PIN0007.BIO   │  \TRNSCRIP     │
  731.  │  PIN0008.BIO   │  \REPLIES      │
  732.  │  ▒▒▒■▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒   │
  733.  └─────────────────────────────────┘
  734.  
  735. The Files list box lists (in two columns of eight) the names of files in the
  736. current directory that match the file-name mask in the Name input box, plus
  737. the parent directory and all sub-directories. You can move up and down a
  738. column or across to another column by using the arrow keys or with a suitable
  739. mouse click.
  740.  
  741.  ┌──────────────────────────────────────────┐
  742.  │ C:\PEDIGREE\MYFAMILY.PED\*.BIO           │  File information
  743.  │ PIN0001.BIO   52    Oct 28,1993  12:00pm │  panel
  744.  └──────────────────────────────────────────┘
  745.  
  746. The File information panel (above) shows the path name, file name, size (in
  747. Bytes), date, and time of the selected file. None of the items on this
  748. information panel is selectable.
  749.  
  750.  ┌──────────┐
  751.  │   Open   │  The Open button opens a new window and
  752.  └──────────┘  places the selected file in that window.
  753.  
  754.  ┌──────────┐
  755.  │  Cancel  │  If you choose Cancel, nothing changes, no action
  756.  └──────────┘  occurs, and the dialogue box is put away.
  757.  
  758. N.B. Esc always cancels a dialogue box, even if a Cancel button does not
  759. appear.
  760.  
  761. While you have the Open a file dialogue box visible, open three of your own
  762. biograph files. If there are not three in your currently selected directory,
  763. you can change to another data set by, for example, entering
  764. C:\PEDIGREE\IGI.PED in the Name input box. This will bring up a list of all
  765. files with the extension .BIO in the IGI data set. Notice that as you open
  766. each file it covers completely covers the earlier ones opened. We are going
  767. to deal with this problem in the next Exercise.
  768.  
  769.  
  770. Tutorial for BIOEDIT text editor part 10
  771.  
  772. Tutorial for BIOEDIT text editor part 10
  773.  
  774.  
  775. Arrange Windows Exercise
  776.  
  777. The Window menu contains commands to close, move and perform other
  778. window-management commands. Most of the windows in BioEdit have all the
  779. standard window elements, including scroll bars, a close box, and zoom
  780. icons.
  781.  
  782. You should have three biograph files open at this stage. Each is in its own
  783. window and each window has the same dimensions and therefore completely
  784. covers any earlier windows that were opened. You can reveal these other
  785. windows by repeatedly pressing function key F5. Try that now and you will see
  786. how it is possible to cycle through the open windows.
  787.  
  788. However, it is often much more useful to be able to refer to one window while
  789. you are working in another. BioEdit facilitates such an arrangement and you
  790. can set up windows as if each window was a 'tile' butting up against its
  791. neighbour(s). If you have three windows open and you now use key sequence
  792. Alt+W followed by T, you will get a tiled arrangement whereby each window
  793. occupies the full width of the screen and about one third of its height. You
  794. can still cycle through the windows, activating each in turn, by repeatedly
  795. pressing F5.
  796.  
  797. If you now press F4 and open another biograph file, it will occupy the entire
  798. screen and obscure the three tiled windows. Cure this by using key sequence
  799. Alt+W followed by T and your will get this tiling arrangement:
  800.  
  801.  ┌────────────────────────────────────┐
  802.  │ ╔════════════1══╗┌────────────2──┐ │
  803.  │ ║               ║│               │ │
  804.  │ ║               ║│               │ │
  805.  │ ║               ║│               │ │
  806.  │ ║               ║│               │ │
  807.  │ ╚═══════════════╝└───────────────┘ │
  808.  │ ┌────────────3──┐┌────────────4──┐ │
  809.  │ │               ││               │ │
  810.  │ │               ││               │ │
  811.  │ │               ││               │ │
  812.  │ │               ││               │ │
  813.  │ └───────────────┘└───────────────┘ │
  814.  └────────────────────────────────────┘
  815.  
  816.                   Tiled Windows
  817.  
  818. The alternative to tiled windows is often known as "Cascade", but is referred
  819. to as Overlap in BioEdit. Use key sequence Alt+W followed by O and you will
  820. get this arrangement:
  821.  
  822.  ┌─────────────────────────────────1─┐
  823.  │┌────────────────────────────────2─┐
  824.  ││┌───────────────────────────────3─┐
  825.  │││╔══════════════════════════════4═╗
  826.  │││║                                ║
  827.  │││║                                ║
  828.  │││║                                ║
  829.  │││║                                ║
  830.  │││║                                ║
  831.  │││║                                ║
  832.  │││║                                ║
  833.  │││║                                ║
  834.  │││║                                ║
  835.  └└└╚════════════════════════════════╝
  836.  
  837.             Overlapped Windows
  838.  
  839. In the diagram above, window 4 is the active window and as it is smaller than
  840. the other three their title bars are visible above and behind it. As before,
  841. you can cycle through the windows using F5, but you can never refer to the
  842. text in one window while working in another. For this reason, many people
  843. prefer the tiled arrangement, but modify the sizes of the tiled windows to
  844. suit themselves. This is the subject of the next exercise.
  845.  
  846.  
  847. Tutorial for BIOEDIT text editor part 11
  848.  
  849. Tutorial for BIOEDIT text editor part 11
  850.  
  851.  
  852. Windows Resizing Exercise
  853.  
  854. Use key sequence Alt+W followed by S to change the size or position of the
  855. active window. When you choose Size/Move, the active window moves in response
  856. to the arrow keys. Once you've moved the window to where you want it, press
  857. Enter. If you have a mouse you can move a window by dragging its title bar
  858. with the mouse button held down.
  859.  
  860. If you press Shift while you use the arrow keys, you can change the size of
  861. the active window. Once you've adjusted its size or position, press Enter. If
  862. you have a mouse and if a window has a Resize corner,  then you can drag that
  863. corner to resize the window and there is no need to use the Shift+Arrow Key
  864. method.
  865.  
  866. Close one of your four windows now. (It does not matter which). Now open the
  867. ASCII.BIO file supplied with BioEdit and Tile the four windows. Make
  868. ASCII.BIO active (if it was not) and reduce its width so as to provide more
  869. room for its horizontal neighbour. Now make this neighbour active and
  870. increase its width so as to utilize the space you have just freed. This is
  871. the sort of arrangement you might want to get back to quickly, so Save
  872. desktop (remember how?) in order to be able to retrieve this rearranged
  873. tiling at a later stage.
  874.  
  875. The active window should still be the one whose size you have just increased.
  876. Use key sequence Alt+W followed by Z  (Zoom) to resize the active window to
  877. the maximum size. This window will now occupy most of the screen. Notice that
  878. it spoils your careful tiling arrangement, but you have two ways to restore
  879. that. Now that the active window has been zoomed, you can choose this command
  880. (Alt+W followed by Z) again to restore it to its previous size. If you have a
  881. mouse, you can double-click (two clicks in quick succession) anywhere on the
  882. window's title bar (except where an icon appears) to zoom or unzoom the
  883. window.
  884.  
  885. Make sure that the active window is zoomed up to maximum size and then use
  886. key sequence Alt+U followed by R to Retrieve desktop. Provided you saved the
  887. desktop as indicated above, you should find that the four windows are tiled
  888. exactly as they were when you did executed the Save desktop command.
  889.  
  890.  
  891. Tutorial for BIOEDIT text editor part 12
  892.  
  893. Tutorial for BIOEDIT text editor part 12
  894.  
  895.  
  896. Utilities Exercise
  897.  
  898. There are now only five menu commands that have not been treated in this
  899. tutorial. Four of them are in the Utilities menu which contains commands that
  900. let you change Colours and Mouse default settings:
  901.  
  902. Mouse....
  903.  
  904. If you do not have a Mouse then the rest of this paragraph is irrelevant and
  905. you should skip to the Palette...  heading. The key sequence Alt+U followed
  906. by M executes the Mouse command that brings up the Mouse Options dialogue
  907. box. In this box you can set various options that control how your mouse
  908. works, including:
  909.  
  910.       ■ how fast a double-click is
  911.       ■ which mouse button (right or left) is active
  912.  
  913. This dialogue box consists of one check box, one slider bar, and the standard
  914. buttons OK and Cancel. The Mouse Double Click slider bar adjusts the
  915. double-click speed of your mouse:
  916.  
  917.  ┌──────────────────────────┐
  918.  │ Mouse Double Click       │
  919.  │ Slow     Medium     Fast │
  920.  │ ▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒■▒▒▒▒▒▒▒▒▒▒ │
  921.  └──────────────────────────┘
  922.  
  923. Reverse Mouse Buttons makes the right mouse button take on the normal
  924. functions of the left--and vice versa. If you click in the box then it will
  925. toggle from [X] (set)  to [ ] (unset).
  926.  
  927.  ┌───────────────────────────┐
  928.  │ [X] Reverse Mouse Buttons │
  929.  └───────────────────────────┘
  930.  
  931.  
  932. Palette..
  933.  
  934. The key sequence Alt+U followed by P brings up the Colours dialogue box,
  935. where you can customize the colours of the display. The Colours dialogue box
  936. consists of two list boxes, a text display area, the standard OK, Cancel, and
  937. Help buttons, and one of the following:
  938.  
  939. ■ On colour and black-and-white systems, it also contains two colour
  940.   palettes.
  941. ■ On monochrome systems, it contains a set of radio buttons instead of the
  942.   palettes.
  943.  
  944. The dialogue box is where you can change the colours of different parts of
  945. this program. The Group list box contains the names of the different regions
  946. of the program that you can customize.
  947.  
  948.  
  949.  ┌─ Group ─────────────┐
  950.  │   Desktop          │
  951.  │   Menus            ■│
  952.  │   Dialogues        ▒│
  953.  │   Editor           ■│
  954.  │   Calendar         ▒│
  955.  │                    ▒│
  956.  │                    ▒│
  957.  │                    │
  958.  └─────────────────────┘
  959.  
  960.  
  961. When you select a group from the Group list, the Item list box displays the
  962. names of the different views in that region.
  963.  
  964.  
  965.  ┌─ Item ──────────────┐
  966.  │   Colour           │
  967.  │                    ■│
  968.  
  969.  
  970. On colour and black-and-white systems, you use the Foreground and Background
  971. palettes to modify colours.
  972.  
  973.  ┌ Foreground ┐   ┌ Background ┐
  974.  │ ░▒▓░▒▓░▒▓░ │   │ ▓░▒▓░▒▓░▒▓ │
  975.  │ ▓░▒▓░▒▓░▒▓ │   │ ░▒▓░▒▓░▒▓░ │
  976.  │ ▒▓░▒▓░▒▓░▒ │   └────────────┘
  977.  └────────────┘
  978.  
  979. On monochrome systems, you use the colours set of radio buttons systems to
  980. modify the character attributes.
  981.  
  982.  ┌ colours ─────────────┐
  983.  │  (∙) Mono low        │
  984.  │  ( ) Mono high       │
  985.  │  ( ) Mono underscore │
  986.  │  ( ) Mono inverse    │
  987.  └──────────────────────┘
  988.  
  989.  
  990. On all systems, the display text (above the Help button) shows the current
  991. colour or attribute settings. Changes do not take effect on the desktop until
  992. you close the colours dialogue box by choosing OK.
  993.  
  994.  ┌────────────────┐
  995.  │ Text Text Text │
  996.  │ Text Text Text │
  997.  └────────────────┘
  998.  
  999.  
  1000. For this exercise you should simply try out the colour settings (and the
  1001. mouse) and learn what effect they have.
  1002.  
  1003.  
  1004. Tutorial for BIOEDIT text editor part 13
  1005.  
  1006. Tutorial for BIOEDIT text editor part 13
  1007.  
  1008.  
  1009. DOS Shell Exercise
  1010.  
  1011. With the DOS Shell command, you can leave BioEdit temporarily to perform a
  1012. DOS command or run another program. Try it now. Use key sequence Alt+U
  1013. followed by D. On some Personal Computers there may not be sufficient memory
  1014. to run the DOS shell. If that is the case then you will get the message:
  1015.  
  1016. Type EXIT to return...
  1017.  
  1018. and then the BioEdit desktop will reappear. If you have sufficient memory
  1019. then the above message will stay on the screen and you can do any of the DOS
  1020. commands that you normally would. Try setting the system clock to British
  1021. Summer Time or Greenwich Mean Time, as appropriate. From the DOS prompt enter
  1022. TIME
  1023.  
  1024. This will generate a prompt such as:
  1025.  
  1026. Current time is 20:37:19.38
  1027. Enter new time: _
  1028.  
  1029.  
  1030. To move the clock back an hour all you need enter is:
  1031.  
  1032. 19:37
  1033.  
  1034. Now enter time again and you will get a prompt such as:
  1035.  
  1036. Current time is 19:37:25.12
  1037. Enter new time: _
  1038.  
  1039. As the objective was simply to check that the time had been reset, all you
  1040. need do is press Enter to leave the reset time as it is. To return to
  1041. BioEdit, enter EXIT at the DOS prompt and you should see that the time now
  1042. displayed at screen top right agrees with your reset time.
  1043.  
  1044. It is highly unlikely that you will be doing this exercise on the day when
  1045. British Summer Time begins or ends, so use key sequence Alt+B followed by S
  1046. to return to the DOS shell and restore the time to its correct setting.
  1047.  
  1048. Finally, enter EXIT to return to BioEdit.
  1049.  
  1050.  
  1051. Tutorial for BIOEDIT text editor part 14
  1052.  
  1053. Tutorial for BIOEDIT text editor part 14
  1054.  
  1055.  
  1056. Print Exercise
  1057.  
  1058. Use key sequence Alt+F followed by P. This will give you a prompt on the
  1059. penultimate line of the screen:
  1060.  
  1061.             File to Print? _
  1062.  
  1063. If you wish to print text that is currently displayed in an open window then
  1064. you need not enter the full path for the file. For example, if you had file
  1065. C:\PEDIGREE\BIOTUTOR.PED\C0021.BIO as the title of an open window, then all
  1066. you need enter is C0021.BIO. Make sure that you printer is connected,
  1067. switched on, and has been initialised. If you output C0021.BIO and find that
  1068. the border characters are not printing properly then the easiest remedy is to
  1069. change the border characters settings next time that you open the data set.
  1070.  
  1071.  
  1072. Finally, press F10 to quit the editor and end this tutorial.
  1073.  
  1074.  
  1075. END OF BIOEDIT TUTORIAL
  1076.  
  1077.