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/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / antibody / !Antibody / GLYCINE_SC < prev    next >
Text File  |  1995-09-25  |  1KB  |  56 lines
  1. zap
  2. load pdb "GLYCINE.PDB"
  3. reset
  4. set hourglass on
  5. rotate z -13
  6. rotate y 37
  7. rotate x 130
  8. translate x -1
  9. translate y 3
  10. colour atoms cpk
  11. spacefill 120
  12. wireframe 40
  13. set fontsize 30
  14. select atomno=1910
  15. label H
  16. select atomno=1906
  17. label O
  18. select atomno=1904
  19. label C
  20. select atomno=1903
  21. label N
  22. script clrleg.scr
  23. echo Glycine, the simplest amino acid.  Not all hydrogens
  24. echo .  are shown.
  25. echo
  26. echo This ball and stick representation does not show the
  27. echo .  true size/shape of the molecule.
  28. pause
  29.  
  30. select all
  31. label off
  32. spacefill
  33. script clrleg.scr
  34. echo GLYCINE:
  35. echo This spacefilling representation shows size and shape
  36. echo .  but hides structure behind the surface.
  37. pause
  38.  
  39. spacefill off
  40. wireframe 0.15
  41. script clrleg.scr
  42. echo GLYCINE:
  43. echo This stick representation shows only bonds, and is better
  44. echo .  for seeing through layers of a molecule.
  45. pause
  46.  
  47. select atomno=1901 or atomno=1903
  48. wireframe
  49. select atomno=1904 or atomno=1907
  50. wireframe
  51. select atomno=1905 or atomno=1909 or atomno=1910
  52. wireframe
  53. script clrleg.scr
  54. echo Now, only the peptide backbone is thick.
  55. pause
  56.