home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / dna3 / !DNA3 / DNA3CZ_SCR < prev    next >
Text File  |  1996-02-25  |  11KB  |  397 lines

  1. #!rasmol -script
  2. # File: DNA3CZ.SCR
  3. # Creator: RasMol Version 2.6
  4.  
  5. background [0,0,0]
  6. zap
  7. load pdb "GAL4_DNA.PDB"
  8. set ambient 60
  9. set specular off
  10.  
  11. reset
  12. slab off
  13. rotate z -82
  14. rotate y 81
  15. rotate x -172
  16. translate x 1
  17. translate y -55
  18. zoom 500
  19.  
  20. set bonds off
  21. set axes off
  22. set boundingbox off
  23. set unitcell off
  24. set bondmode and
  25. dots off
  26.  
  27.  
  28. # Avoid Colour Problems!
  29. select all
  30. colour bonds none
  31. colour backbone none
  32. colour hbonds none
  33. colour ssbonds none
  34. colour ribbons none
  35. colour white
  36.  
  37. # Atoms
  38. select (atomno>=1) and (atomno<=8)
  39. colour atoms [150,150,150]
  40. select (atomno>=9) and (atomno<=16)
  41. colour atoms [255,0,0]
  42. select (atomno>=17) and (atomno<=27)
  43. colour atoms [150,150,150]
  44. select (atomno>=28) and (atomno<=35)
  45. colour atoms [255,0,0]
  46. select (atomno>=36) and (atomno<=46)
  47. colour atoms [150,150,150]
  48. select (atomno>=47) and (atomno<=57)
  49. colour atoms [0,255,0]
  50. select (atomno>=58) and (atomno<=68)
  51. colour atoms [150,150,150]
  52. select (atomno>=69) and (atomno<=79)
  53. colour atoms [0,255,0]
  54. select (atomno>=80) and (atomno<=90)
  55. colour atoms [150,150,150]
  56. select (atomno>=91) and (atomno<=100)
  57. colour atoms [0,0,255]
  58. select (atomno>=101) and (atomno<=111)
  59. colour atoms [150,150,150]
  60. select (atomno>=112) and (atomno<=122)
  61. colour atoms [0,255,0]
  62. select (atomno>=123) and (atomno<=133)
  63. colour atoms [150,150,150]
  64. select (atomno>=134) and (atomno<=144)
  65. colour atoms [0,255,0]
  66. select (atomno>=145) and (atomno<=155)
  67. colour atoms [150,150,150]
  68. select (atomno>=156) and (atomno<=165)
  69. colour atoms [0,0,255]
  70. select (atomno>=166) and (atomno<=176)
  71. colour atoms [150,150,150]
  72. select (atomno>=177) and (atomno<=184)
  73. colour atoms [255,0,0]
  74. select (atomno>=185) and (atomno<=195)
  75. colour atoms [150,150,150]
  76. select (atomno>=196) and (atomno<=205)
  77. colour atoms [0,0,255]
  78. select (atomno>=206) and (atomno<=216)
  79. colour atoms [150,150,150]
  80. select (atomno>=217) and (atomno<=227)
  81. colour atoms [0,255,0]
  82. select (atomno>=228) and (atomno<=238)
  83. colour atoms [150,150,150]
  84. select (atomno>=239) and (atomno<=247)
  85. colour atoms [255,255,0]
  86. select (atomno>=248) and (atomno<=258)
  87. colour atoms [150,150,150]
  88. select (atomno>=259) and (atomno<=266)
  89. colour atoms [255,0,0]
  90. select (atomno>=267) and (atomno<=277)
  91. colour atoms [150,150,150]
  92. select (atomno>=278) and (atomno<=285)
  93. colour atoms [255,0,0]
  94. select (atomno>=286) and (atomno<=296)
  95. colour atoms [150,150,150]
  96. select (atomno>=297) and (atomno<=305)
  97. colour atoms [255,255,0]
  98. select (atomno>=306) and (atomno<=316)
  99. colour atoms [150,150,150]
  100. select (atomno>=317) and (atomno<=324)
  101. colour atoms [255,0,0]
  102. select (atomno>=325) and (atomno<=335)
  103. colour atoms [150,150,150]
  104. select (atomno>=336) and (atomno<=343)
  105. colour atoms [255,0,0]
  106. select (atomno>=344) and (atomno<=354)
  107. colour atoms [150,150,150]
  108. select (atomno>=355) and (atomno<=365)
  109. colour atoms [0,255,0]
  110. select (atomno>=366) and (atomno<=376)
  111. colour atoms [150,150,150]
  112. select (atomno>=377) and (atomno<=387)
  113. colour atoms [0,255,0]
  114. select (atomno>=389) and (atomno<=396)
  115. colour atoms [150,150,150]
  116. select (atomno>=397) and (atomno<=404)
  117. colour atoms [255,0,0]
  118. select (atomno>=405) and (atomno<=415)
  119. colour atoms [150,150,150]
  120. select (atomno>=416) and (atomno<=423)
  121. colour atoms [255,0,0]
  122. select (atomno>=424) and (atomno<=434)
  123. colour atoms [150,150,150]
  124. select (atomno>=435) and (atomno<=445)
  125. colour atoms [0,255,0]
  126. select (atomno>=446) and (atomno<=456)
  127. colour atoms [150,150,150]
  128. select (atomno>=457) and (atomno<=467)
  129. colour atoms [0,255,0]
  130. select (atomno>=468) and (atomno<=478)
  131. colour atoms [150,150,150]
  132. select (atomno>=479) and (atomno<=488)
  133. colour atoms [0,0,255]
  134. select (atomno>=489) and (atomno<=499)
  135. colour atoms [150,150,150]
  136. select (atomno>=500) and (atomno<=510)
  137. colour atoms [0,255,0]
  138. select (atomno>=511) and (atomno<=521)
  139. colour atoms [150,150,150]
  140. select (atomno>=522) and (atomno<=532)
  141. colour atoms [0,255,0]
  142. select (atomno>=533) and (atomno<=543)
  143. colour atoms [150,150,150]
  144. select (atomno>=544) and (atomno<=553)
  145. colour atoms [0,0,255]
  146. select (atomno>=554) and (atomno<=564)
  147. colour atoms [150,150,150]
  148. select (atomno>=565) and (atomno<=572)
  149. colour atoms [255,0,0]
  150. select (atomno>=573) and (atomno<=583)
  151. colour atoms [150,150,150]
  152. select (atomno>=584) and (atomno<=592)
  153. colour atoms [255,255,0]
  154. select (atomno>=593) and (atomno<=603)
  155. colour atoms [150,150,150]
  156. select (atomno>=604) and (atomno<=614)
  157. colour atoms [0,255,0]
  158. select (atomno>=615) and (atomno<=625)
  159. colour atoms [150,150,150]
  160. select (atomno>=626) and (atomno<=634)
  161. colour atoms [255,255,0]
  162. select (atomno>=635) and (atomno<=645)
  163. colour atoms [150,150,150]
  164. select (atomno>=646) and (atomno<=653)
  165. colour atoms [255,0,0]
  166. select (atomno>=654) and (atomno<=664)
  167. colour atoms [150,150,150]
  168. select (atomno>=665) and (atomno<=672)
  169. colour atoms [255,0,0]
  170. select (atomno>=673) and (atomno<=683)
  171. colour atoms [150,150,150]
  172. select (atomno>=684) and (atomno<=692)
  173. colour atoms [255,255,0]
  174. select (atomno>=693) and (atomno<=703)
  175. colour atoms [150,150,150]
  176. select (atomno>=704) and (atomno<=711)
  177. colour atoms [255,0,0]
  178. select (atomno>=712) and (atomno<=722)
  179. colour atoms [150,150,150]
  180. select (atomno>=723) and (atomno<=730)
  181. colour atoms [255,0,0]
  182. select (atomno>=731) and (atomno<=741)
  183. colour atoms [150,150,150]
  184. select (atomno>=742) and (atomno<=752)
  185. colour atoms [0,255,0]
  186. select (atomno>=753) and (atomno<=763)
  187. colour atoms [150,150,150]
  188. select (atomno>=764) and (atomno<=774)
  189. colour atoms [0,255,0]
  190. select (atomno>=776) and (atomno<=1766)
  191. colour atoms cpk
  192. select all
  193. spacefill off
  194.  
  195. # Bonds
  196. wireframe off
  197. select (atomno=592) or (atomno==590)
  198. wireframe 75
  199. select (atomno=592) or (atomno==584)
  200. wireframe 75
  201. select (atomno=591) or (atomno==590)
  202. wireframe 75
  203. select (atomno=590) or (atomno==588)
  204. wireframe 75
  205. select (atomno=589) or (atomno==588)
  206. wireframe 75
  207. select (atomno=588) or (atomno==587)
  208. wireframe 75
  209. select (atomno=587) or (atomno==585)
  210. wireframe 75
  211. select (atomno=586) or (atomno==585)
  212. wireframe 75
  213. select (atomno=585) or (atomno==584)
  214. wireframe 75
  215. select (atomno=584) or (atomno==583)
  216. wireframe 75
  217. select (atomno=583) or (atomno==579)
  218. wireframe 75
  219. select (atomno=583) or (atomno==582)
  220. wireframe 75
  221. select (atomno=582) or (atomno==580)
  222. wireframe 75
  223. select (atomno=581) or (atomno==580)
  224. wireframe 75
  225. select (atomno=580) or (atomno==578)
  226. wireframe 75
  227. select (atomno=579) or (atomno==578)
  228. wireframe 75
  229. select (atomno=578) or (atomno==577)
  230. wireframe 75
  231. select (atomno=577) or (atomno==576)
  232. wireframe 75
  233. select (atomno=576) or (atomno==573)
  234. wireframe 75
  235. select (atomno=575) or (atomno==573)
  236. wireframe 75
  237. select (atomno=574) or (atomno==573)
  238. wireframe 75
  239. select (atomno=573) or (atomno==562)
  240. wireframe 75
  241. select (atomno=572) or (atomno==565)
  242. wireframe 75
  243. select (atomno=572) or (atomno==571)
  244. wireframe 75
  245. select (atomno=571) or (atomno==569)
  246. wireframe 75
  247. select (atomno=570) or (atomno==569)
  248. wireframe 75
  249. select (atomno=569) or (atomno==568)
  250. wireframe 75
  251. select (atomno=568) or (atomno==566)
  252. wireframe 75
  253. select (atomno=567) or (atomno==566)
  254. wireframe 75
  255. select (atomno=566) or (atomno==565)
  256. wireframe 75
  257. select (atomno=565) or (atomno==564)
  258. wireframe 75
  259. select (atomno=564) or (atomno==563)
  260. wireframe 75
  261. select (atomno=564) or (atomno==560)
  262. wireframe 75
  263. select (atomno=563) or (atomno==561)
  264. wireframe 75
  265. select (atomno=562) or (atomno==561)
  266. wireframe 75
  267. select (atomno=561) or (atomno==559)
  268. wireframe 75
  269. select (atomno=560) or (atomno==559)
  270. wireframe 75
  271. select (atomno=559) or (atomno==558)
  272. wireframe 75
  273. select (atomno=558) or (atomno==557)
  274. wireframe 75
  275. select (atomno=557) or (atomno==554)
  276. wireframe 75
  277. select (atomno=556) or (atomno==554)
  278. wireframe 75
  279. select (atomno=555) or (atomno==554)
  280. wireframe 75
  281. select (atomno=227) or (atomno==220)
  282. wireframe 75
  283. select (atomno=227) or (atomno==226)
  284. wireframe 75
  285. select (atomno=227) or (atomno==217)
  286. wireframe 75
  287. select (atomno=226) or (atomno==224)
  288. wireframe 75
  289. select (atomno=225) or (atomno==224)
  290. wireframe 75
  291. select (atomno=224) or (atomno==223)
  292. wireframe 75
  293. select (atomno=223) or (atomno==221)
  294. wireframe 75
  295. se