home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / dna3 / !DNA3 / DNA3DZ_SCR < prev    next >
Text File  |  1996-02-25  |  6KB  |  221 lines

  1. #!rasmol -script
  2. # File: DNA3DZ.SCR
  3. # Creator: RasMol Version 2.6
  4.  
  5. background [0,0,0]
  6. zap
  7. load pdb "GAL4_DNA.PDB"
  8. set ambient 60
  9. set specular off
  10.  
  11. reset
  12. slab off
  13. rotate z -82
  14. rotate y 81
  15. rotate x -172
  16. translate x 1
  17. translate y -55
  18. zoom 500
  19.  
  20. set axes off
  21. set boundingbox off
  22. set unitcell off
  23. set hbond sidechain
  24. set bondmode and
  25. dots off
  26.  
  27.  
  28. # Avoid Colour Problems!
  29. select all
  30. colour bonds none
  31. colour backbone none
  32. colour hbonds none
  33. colour ssbonds none
  34. colour ribbons none
  35. colour white
  36.  
  37. # Atoms
  38. select (atomno>=1) and (atomno<=8)
  39. colour atoms [150,150,150]
  40. select (atomno>=9) and (atomno<=16)
  41. colour atoms [255,0,0]
  42. select (atomno>=17) and (atomno<=27)
  43. colour atoms [150,150,150]
  44. select (atomno>=28) and (atomno<=35)
  45. colour atoms [255,0,0]
  46. select (atomno>=36) and (atomno<=46)
  47. colour atoms [150,150,150]
  48. select (atomno>=47) and (atomno<=57)
  49. colour atoms [0,255,0]
  50. select (atomno>=58) and (atomno<=68)
  51. colour atoms [150,150,150]
  52. select (atomno>=69) and (atomno<=79)
  53. colour atoms [0,255,0]
  54. select (atomno>=80) and (atomno<=90)
  55. colour atoms [150,150,150]
  56. select (atomno>=91) and (atomno<=100)
  57. colour atoms [0,0,255]
  58. select (atomno>=101) and (atomno<=111)
  59. colour atoms [150,150,150]
  60. select (atomno>=112) and (atomno<=122)
  61. colour atoms [0,255,0]
  62. select (atomno>=123) and (atomno<=133)
  63. colour atoms [150,150,150]
  64. select (atomno>=134) and (atomno<=144)
  65. colour atoms [0,255,0]
  66. select (atomno>=145) and (atomno<=155)
  67. colour atoms [150,150,150]
  68. select (atomno>=156) and (atomno<=165)
  69. colour atoms [0,0,255]
  70. select (atomno>=166) and (atomno<=176)
  71. colour atoms [150,150,150]
  72. select (atomno>=177) and (atomno<=184)
  73. colour atoms [255,0,0]
  74. select (atomno>=185) and (atomno<=227)
  75. colour atoms cpk
  76. select (atomno>=228) and (atomno<=238)
  77. colour atoms [150,150,150]
  78. select (atomno>=239) and (atomno<=247)
  79. colour atoms [255,255,0]
  80. select (atomno>=248) and (atomno<=258)
  81. colour atoms [150,150,150]
  82. select (atomno>=259) and (atomno<=266)
  83. colour atoms [255,0,0]
  84. select (atomno>=267) and (atomno<=277)
  85. colour atoms [150,150,150]
  86. select (atomno>=278) and (atomno<=285)
  87. colour atoms [255,0,0]
  88. select (atomno>=286) and (atomno<=296)
  89. colour atoms [150,150,150]
  90. select (atomno>=297) and (atomno<=305)
  91. colour atoms [255,255,0]
  92. select (atomno>=306) and (atomno<=316)
  93. colour atoms [150,150,150]
  94. select (atomno>=317) and (atomno<=324)
  95. colour atoms [255,0,0]
  96. select (atomno>=325) and (atomno<=335)
  97. colour atoms [150,150,150]
  98. select (atomno>=336) and (atomno<=343)
  99. colour atoms [255,0,0]
  100. select (atomno>=344) and (atomno<=354)
  101. colour atoms [150,150,150]
  102. select (atomno>=355) and (atomno<=365)
  103. colour atoms [0,255,0]
  104. select (atomno>=366) and (atomno<=376)
  105. colour atoms [150,150,150]
  106. select (atomno>=377) and (atomno<=387)
  107. colour atoms [0,255,0]
  108. select (atomno>=389) and (atomno<=396)
  109. colour atoms [150,150,150]
  110. select (atomno>=397) and (atomno<=404)
  111. colour atoms [255,0,0]
  112. select (atomno>=405) and (atomno<=415)
  113. colour atoms [150,150,150]
  114. select (atomno>=416) and (atomno<=423)
  115. colour atoms [255,0,0]
  116. select (atomno>=424) and (atomno<=434)
  117. colour atoms [150,150,150]
  118. select (atomno>=435) and (atomno<=445)
  119. colour atoms [0,255,0]
  120. select (atomno>=446) and (atomno<=456)
  121. colour atoms [150,150,150]
  122. select (atomno>=457) and (atomno<=467)
  123. colour atoms [0,255,0]
  124. select (atomno>=468) and (atomno<=478)
  125. colour atoms [150,150,150]
  126. select (atomno>=479) and (atomno<=488)
  127. colour atoms [0,0,255]
  128. select (atomno>=489) and (atomno<=499)
  129. colour atoms [150,150,150]
  130. select (atomno>=500) and (atomno<=510)
  131. colour atoms [0,255,0]
  132. select (atomno>=511) and (atomno<=521)
  133. colour atoms [150,150,150]
  134. select (atomno>=522) and (atomno<=532)
  135. colour atoms [0,255,0]
  136. select (atomno>=533) and (atomno<=543)
  137. colour atoms [150,150,150]
  138. select (atomno>=544) and (atomno<=553)
  139. colour atoms [0,0,255]
  140. select (atomno>=554) and (atomno<=592)
  141. colour atoms cpk
  142. select (atomno>=593) and (atomno<=603)
  143. colour atoms [150,150,150]
  144. select (atomno>=604) and (atomno<=614)
  145. colour atoms [0,255,0]
  146. select (atomno>=615) and (atomno<=625)
  147. colour atoms [150,150,150]
  148. select (atomno>=626) and (atomno<=634)
  149. colour atoms [255,255,0]
  150. select (atomno>=635) and (atomno<=645)
  151. colour atoms [150,150,150]
  152. select (atomno>=646) and (atomno<=653)
  153. colour atoms [255,0,0]
  154. select (atomno>=654) and (atomno<=664)
  155. colour atoms [150,150,150]
  156. select (atomno>=665) and (atomno<=672)
  157. colour atoms [255,0,0]
  158. select (atomno>=673) and (atomno<=683)
  159. colour atoms [150,150,150]
  160. select (atomno>=684) and (atomno<=692)
  161. colour atoms [255,255,0]
  162. select (atomno>=693) and (atomno<=703)
  163. colour atoms [150,150,150]
  164. select (atomno>=704) and (atomno<=711)
  165. colour atoms [255,0,0]
  166. select (atomno>=712) and (atomno<=722)
  167. colour atoms [150,150,150]
  168. select (atomno>=723) and (atomno<=730)
  169. colour atoms [255,0,0]
  170. select (atomno>=731) and (atomno<=741)
  171. colour atoms [150,150,150]
  172. select (atomno>=742) and (atomno<=752)
  173. colour atoms [0,255,0]
  174. select (atomno>=753) and (atomno<=763)
  175. colour atoms [150,150,150]
  176. select (atomno>=764) and (atomno<=774)
  177. colour atoms [0,255,0]
  178. select (atomno>=776) and (atomno<=1766)
  179. colour atoms cpk
  180. select (atomno>=1) and (atomno<=205)
  181. spacefill off
  182. select (atomno>=206) and (atomno<=227)
  183. spacefill on
  184. select (atomno>=228) and (atomno<=553)
  185. spacefill off
  186. select (atomno>=554) and (atomno<=572)
  187. spacefill on
  188. select (atomno>=573) and (atomno<=1766)
  189. spacefill off
  190. set shadow off
  191.  
  192. # Bonds
  193. select all
  194. wireframe off
  195.  
  196. # Ribbons
  197. ribbons off
  198.  
  199. # Backbone
  200. backbone off
  201.  
  202. # Labels
  203. labels off
  204. colour labels [255,255,255]
  205. set fontsize 32
  206. select atomno=214
  207. label "G"
  208. select atomno=556
  209. label "C"
  210.  
  211. # Monitors
  212. monitors off
  213.  
  214. select all
  215. ssbonds off
  216. hbonds off
  217.  
  218. refresh
  219. restrict 11:d or 28:e
  220. center selected
  221.