home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / dna3 / !DNA3 / DNA3EZ_SCR < prev    next >
Text File  |  1996-02-25  |  46KB  |  1,797 lines

  1. #!rasmol -script
  2. # File: DNA3EZ.SCR
  3. # Creator: RasMol Version 2.6
  4.  
  5. background [0,0,0]
  6. zap
  7. load pdb "GAL4_DNA.PDB"
  8. set ambient 60
  9. set specular off
  10.  
  11. reset
  12. slab off
  13. rotate z -90
  14. rotate y -8
  15. rotate x -178
  16. translate x 8
  17. translate y -30
  18. zoom 200
  19.  
  20. set bonds off
  21. set axes off
  22. set boundingbox off
  23. set unitcell off
  24. set bondmode and
  25. dots off
  26.  
  27.  
  28. # Avoid Colour Problems!
  29. select all
  30. colour bonds none
  31. colour backbone none
  32. colour hbonds none
  33. colour ssbonds none
  34. colour ribbons none
  35. colour white
  36.  
  37. # Atoms
  38. select (atomno>=1) and (atomno<=205)
  39. colour atoms [0,0,255]
  40. select (atomno>=206) and (atomno<=227)
  41. colour atoms cpk
  42. select (atomno>=228) and (atomno<=387)
  43. colour atoms [0,0,255]
  44. select (atomno>=389) and (atomno<=553)
  45. colour atoms [0,255,255]
  46. select (atomno>=554) and (atomno<=572)
  47. colour atoms cpk
  48. select (atomno>=573) and (atomno<=774)
  49. colour atoms [0,255,255]
  50. select (atomno>=776) and (atomno<=1766)
  51. colour atoms cpk
  52. select all
  53. spacefill off
  54.  
  55. # Bonds
  56. wireframe off
  57. select (atomno=774) or (atomno==764)
  58. wireframe 75
  59. select (atomno=774) or (atomno==767)
  60. wireframe 75
  61. select (atomno=774) or (atomno==773)
  62. wireframe 75
  63. select (atomno=773) or (atomno==771)
  64. wireframe 75
  65. select (atomno=772) or (atomno==771)
  66. wireframe 75
  67. select (atomno=771) or (atomno==770)
  68. wireframe 75
  69. select (atomno=770) or (atomno==768)
  70. wireframe 75
  71. select (atomno=769) or (atomno==768)
  72. wireframe 75
  73. select (atomno=768) or (atomno==767)
  74. wireframe 75
  75. select (atomno=767) or (atomno==766)
  76. wireframe 75
  77. select (atomno=766) or (atomno==765)
  78. wireframe 75
  79. select (atomno=765) or (atomno==764)
  80. wireframe 75
  81. select (atomno=764) or (atomno==763)
  82. wireframe 75
  83. select (atomno=763) or (atomno==759)
  84. wireframe 75
  85. select (atomno=763) or (atomno==762)
  86. wireframe 75
  87. select (atomno=762) or (atomno==760)
  88. wireframe 75
  89. select (atomno=761) or (atomno==760)
  90. wireframe 75
  91. select (atomno=760) or (atomno==758)
  92. wireframe 75
  93. select (atomno=759) or (atomno==758)
  94. wireframe 75
  95. select (atomno=758) or (atomno==757)
  96. wireframe 75
  97. select (atomno=757) or (atomno==756)
  98. wireframe 75
  99. select (atomno=756) or (atomno==753)
  100. wireframe 75
  101. select (atomno=755) or (atomno==753)
  102. wireframe 75
  103. select (atomno=754) or (atomno==753)
  104. wireframe 75
  105. select (atomno=753) or (atomno==739)
  106. wireframe 75
  107. select (atomno=752) or (atomno==742)
  108. wireframe 75
  109. select (atomno=752) or (atomno==745)
  110. wireframe 75
  111. select (atomno=752) or (atomno==751)
  112. wireframe 75
  113. select (atomno=751) or (atomno==749)
  114. wireframe 75
  115. select (atomno=750) or (atomno==749)
  116. wireframe 75
  117. select (atomno=749) or (atomno==748)
  118. wireframe 75
  119. select (atomno=748) or (atomno==746)
  120. wireframe 75
  121. select (atomno=747) or (atomno==746)
  122. wireframe 75
  123. select (atomno=746) or (atomno==745)
  124. wireframe 75
  125. select (atomno=745) or (atomno==744)
  126. wireframe 75
  127. select (atomno=744) or (atomno==743)
  128. wireframe 75
  129. select (atomno=743) or (atomno==742)
  130. wireframe 75
  131. select (atomno=742) or (atomno==741)
  132. wireframe 75
  133. select (atomno=741) or (atomno==737)
  134. wireframe 75
  135. select (atomno=741) or (atomno==740)
  136. wireframe 75
  137. select (atomno=740) or (atomno==738)
  138. wireframe 75
  139. select (atomno=739) or (atomno==738)
  140. wireframe 75
  141. select (atomno=738) or (atomno==736)
  142. wireframe 75
  143. select (atomno=737) or (atomno==736)
  144. wireframe 75
  145. select (atomno=736) or (atomno==735)
  146. wireframe 75
  147. select (atomno=735) or (atomno==734)
  148. wireframe 75
  149. select (atomno=734) or (atomno==731)
  150. wireframe 75
  151. select (atomno=733) or (atomno==731)
  152. wireframe 75
  153. select (atomno=732) or (atomno==731)
  154. wireframe 75
  155. select (atomno=731) or (atomno==720)
  156. wireframe 75
  157. select (atomno=730) or (atomno==723)
  158. wireframe 75
  159. select (atomno=730) or (atomno==729)
  160. wireframe 75
  161. select (atomno=729) or (atomno==727)
  162. wireframe 75
  163. select (atomno=728) or (atomno==727)
  164. wireframe 75
  165. select (atomno=727) or (atomno==726)
  166. wireframe 75
  167. select (atomno=726) or (atomno==724)
  168. wireframe 75
  169. select (atomno=725) or (atomno==724)
  170. wireframe 75
  171. select (atomno=724) or (atomno==723)
  172. wireframe 75
  173. select (atomno=723) or (atomno==722)
  174. wireframe 75
  175. select (atomno=722) or (atomno==721)
  176. wireframe 75
  177. select (atomno=722) or (atomno==718)
  178. wireframe 75
  179. select (atomno=721) or (atomno==719)
  180. wireframe 75
  181. select (atomno=720) or (atomno==719)
  182. wireframe 75
  183. select (atomno=719) or (atomno==717)
  184. wireframe 75
  185. select (atomno=718) or (atomno==717)
  186. wireframe 75
  187. select (atomno=717) or (atomno==716)
  188. wireframe 75
  189. select (atomno=716) or (atomno==715)
  190. wireframe 75
  191. select (atomno=715) or (atomno==712)
  192. wireframe 75
  193. select (atomno=714) or (atomno==712)
  194. wireframe 75
  195. select (atomno=713) or (atomno==712)
  196. wireframe 75
  197. select (atomno=712) or (atomno==701)
  198. wireframe 75
  199. select (atomno=711) or (atomno==704)
  200. wireframe 75
  201. select (atomno=711) or (atomno==710)
  202. wireframe 75
  203. select (atomno=710) or (atomno==708)
  204. wireframe 75
  205. select (atomno=709) or (atomno==708)
  206. wireframe 75
  207. select (atomno=708) or (atomno==707)
  208. wireframe 75
  209. select (atomno=707) or (atomno==705)
  210. wireframe 75
  211. select (atomno=706) or (atomno==705)
  212. wireframe 75
  213. select (atomno=705) or (atomno==704)
  214. wireframe 75
  215. select (atomno=704) or (atomno==703)
  216. wireframe 75
  217. select (atomno=703) or (atomno==699)
  218. wireframe 75
  219. select (atomno=703) or (atomno==702)
  220. wireframe 75
  221. select (atomno=702) or (atomno==700)
  222. wireframe 75
  223. select (atomno=701) or (atomno==700)
  224. wireframe 75
  225. select (atomno=700) or (atomno==698)
  226. wireframe 75
  227. select (atomno=699) or (atomno==698)
  228. wireframe 75
  229. select (atomno=698) or (atomno==697)
  230. wireframe 75
  231. select (atomno=697) or (atomno==696)
  232. wireframe 75
  233. select (atomno=696) or (atomno==693)
  234. wireframe 75
  235. select (atomno=695) or (atomno==693)
  236. wireframe 75
  237. select (atomno=694) or (atomno==693)
  238. wireframe 75
  239. select (atomno=693) or (atomno==681)
  240. wireframe 75
  241. select (atomno=692) or (atomno==684)
  242. wireframe 75
  243. select (atomno=692) or (atomno==690)
  244. wireframe 75
  245. select (atomno=691) or (atomno==690)
  246. wireframe 75
  247. select (atomno=690) or (atomno==688)
  248. wireframe 75
  249. select (atomno=689) or (atomno==688)
  250. wireframe 75
  251. select (atomno=688) or (atomno==687)
  252. wireframe 75
  253. select (atomno=687) or (atomno==685)
  254. wireframe 75
  255. select (atomno=686) or (atomno==685)
  256. wireframe 75
  257. select (atomno=685) or (atomno==684)
  258. wireframe 75
  259. select (atomno=684) or (atomno==683)
  260. wireframe 75
  261. select (atomno=683) or (atomno==679)
  262. wireframe 75
  263. select (atomno=683) or (atomno==682)
  264. wireframe 75
  265. select (atomno=682) or (atomno==680)
  266. wireframe 75
  267. select (atomno=681) or (atomno==680)
  268. wireframe 75
  269. select (atomno=680) or (atomno==678)
  270. wireframe 75
  271. select (atomno=679) or (atomno==678)
  272. wireframe 75
  273. select (atomno=678) or (atomno==677)
  274. wireframe 75
  275. select (atomno=677) or (atomno==676)
  276. wireframe 75
  277. select (atomno=676) or (atomno==673)
  278. wireframe 75
  279. select (atomno=675) or (atomno==673)
  280. wireframe 75
  281. select (atomno=674) or (atomno==673)
  282. wireframe 75
  283. select (atomno=673) or (atomno==662)
  284. wireframe 75
  285. select (atomno=672) or (atomno==665)
  286. wireframe 75
  287. select (atomno=672) or (atomno==671)
  288. wireframe 75
  289. select (atomno=671) or (atomno==669)
  290. wireframe 75
  291. select (atomno=670) or (atomno==669)
  292. wireframe 75
  293. select (atomno=669) or (atomno==668)
  294. wireframe 75
  295. select (atomno=668) or (atomno==666)
  296. wireframe 75
  297. select (atomno=667) or (atomno==666)
  298. wireframe 75
  299. select (atomno=666) or (atomno==665)
  300. wireframe 75
  301. select (atomno=665) or (atomno==664)
  302. wireframe 75
  303. select (atomno=664) or (atomno==660)
  304. wireframe 75
  305. select (atomno=664) or (atomno==663)
  306. wireframe 75
  307. select (atomno=663) or (atomno==661)
  308. wireframe 75
  309. select (atomno=662) or (atomno==661)
  310. wireframe 75
  311. select (atomno=661) or (atomno==659)
  312. wireframe 75
  313. select (atomno=660) or (atomno==659)
  314. wireframe 75
  315. select (atomno=659) or (atomno==658)
  316. wireframe 75
  317. select (atomno=658) or (atomno==657)
  318. wireframe 75
  319. select (atomno=657) or (atomno==654)
  320. wireframe 75
  321. select (atomno=656) or (atomno==654)
  322. wireframe 75
  323. select (atomno=655) or (atomno==654)
  324. wireframe 75
  325. select (atomno=654) or (atomno==643)
  326. wireframe 75
  327. select (atomno=653) or (atomno==646)
  328. wireframe 75
  329. select (atomno=653) or (atomno==652)
  330. wireframe 75
  331. select (atomno=652) or (atomno==650)
  332. wireframe 75
  333. sele