home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / dna3 / !DNA3 / DNA3FZ_SCR < prev    next >
Text File  |  1996-02-28  |  57KB  |  2,154 lines

  1. #!rasmol -script
  2. # File: DNA3FZ.SCR
  3. # Creator: RasMol Version 2.6
  4.  
  5. background [0,0,0]
  6. zap
  7. load pdb "GAL4_DNA.PDB"
  8. set ambient 60
  9. set specular off
  10.  
  11. reset
  12. slab off
  13. rotate z -90
  14. rotate y -7
  15. rotate x -88
  16. translate y -5
  17. zoom 200
  18.  
  19. set bonds off
  20. set axes off
  21. set boundingbox off
  22. set unitcell off
  23. set hbond sidechain
  24. set bondmode and
  25. dots off
  26.  
  27.  
  28. # Avoid Colour Problems!
  29. select all
  30. colour bonds none
  31. colour backbone none
  32. colour hbonds none
  33. colour ssbonds none
  34. colour ribbons none
  35. colour white
  36.  
  37. # Atoms
  38. select (atomno>=1) and (atomno<=8)
  39. colour atoms [150,150,150]
  40. select (atomno>=9) and (atomno<=16)
  41. colour atoms [255,0,0]
  42. select (atomno>=17) and (atomno<=27)
  43. colour atoms [150,150,150]
  44. select (atomno>=28) and (atomno<=35)
  45. colour atoms [255,0,0]
  46. select (atomno>=36) and (atomno<=46)
  47. colour atoms [150,150,150]
  48. select (atomno>=47) and (atomno<=57)
  49. colour atoms [0,255,0]
  50. select (atomno>=58) and (atomno<=68)
  51. colour atoms [150,150,150]
  52. select (atomno>=69) and (atomno<=79)
  53. colour atoms [0,255,0]
  54. select (atomno>=80) and (atomno<=90)
  55. colour atoms [150,150,150]
  56. select (atomno>=91) and (atomno<=100)
  57. colour atoms [0,0,255]
  58. select (atomno>=101) and (atomno<=111)
  59. colour atoms [150,150,150]
  60. select (atomno>=112) and (atomno<=122)
  61. colour atoms [0,255,0]
  62. select (atomno>=123) and (atomno<=133)
  63. colour atoms [150,150,150]
  64. select (atomno>=134) and (atomno<=144)
  65. colour atoms [0,255,0]
  66. select (atomno>=145) and (atomno<=155)
  67. colour atoms [150,150,150]
  68. select (atomno>=156) and (atomno<=165)
  69. colour atoms [0,0,255]
  70. select (atomno>=166) and (atomno<=176)
  71. colour atoms [150,150,150]
  72. select (atomno>=177) and (atomno<=184)
  73. colour atoms [255,0,0]
  74. select (atomno>=185) and (atomno<=195)
  75. colour atoms [150,150,150]
  76. select (atomno>=196) and (atomno<=205)
  77. colour atoms [0,0,255]
  78. select (atomno>=206) and (atomno<=216)
  79. colour atoms [150,150,150]
  80. select (atomno>=217) and (atomno<=227)
  81. colour atoms [0,255,0]
  82. select (atomno>=228) and (atomno<=238)
  83. colour atoms [150,150,150]
  84. select (atomno>=239) and (atomno<=247)
  85. colour atoms [255,255,0]
  86. select (atomno>=248) and (atomno<=258)
  87. colour atoms [150,150,150]
  88. select (atomno>=259) and (atomno<=266)
  89. colour atoms [255,0,0]
  90. select (atomno>=267) and (atomno<=277)
  91. colour atoms [150,150,150]
  92. select (atomno>=278) and (atomno<=285)
  93. colour atoms [255,0,0]
  94. select (atomno>=286) and (atomno<=296)
  95. colour atoms [150,150,150]
  96. select (atomno>=297) and (atomno<=305)
  97. colour atoms [255,255,0]
  98. select (atomno>=306) and (atomno<=316)
  99. colour atoms [150,150,150]
  100. select (atomno>=317) and (atomno<=324)
  101. colour atoms [255,0,0]
  102. select (atomno>=325) and (atomno<=335)
  103. colour atoms [150,150,150]
  104. select (atomno>=336) and (atomno<=343)
  105. colour atoms [255,0,0]
  106. select (atomno>=344) and (atomno<=354)
  107. colour atoms [150,150,150]
  108. select (atomno>=355) and (atomno<=365)
  109. colour atoms [0,255,0]
  110. select (atomno>=366) and (atomno<=376)
  111. colour atoms [150,150,150]
  112. select (atomno>=377) and (atomno<=387)
  113. colour atoms [0,255,0]
  114. select (atomno>=389) and (atomno<=396)
  115. colour atoms [150,150,150]
  116. select (atomno>=397) and (atomno<=404)
  117. colour atoms [255,0,0]
  118. select (atomno>=405) and (atomno<=415)
  119. colour atoms [150,150,150]
  120. select (atomno>=416) and (atomno<=423)
  121. colour atoms [255,0,0]
  122. select (atomno>=424) and (atomno<=434)
  123. colour atoms [150,150,150]
  124. select (atomno>=435) and (atomno<=445)
  125. colour atoms [0,255,0]
  126. select (atomno>=446) and (atomno<=456)
  127. colour atoms [150,150,150]
  128. select (atomno>=457) and (atomno<=467)
  129. colour atoms [0,255,0]
  130. select (atomno>=468) and (atomno<=478)
  131. colour atoms [150,150,150]
  132. select (atomno>=479) and (atomno<=488)
  133. colour atoms [0,0,255]
  134. select (atomno>=489) and (atomno<=499)
  135. colour atoms [150,150,150]
  136. select (atomno>=500) and (atomno<=510)
  137. colour atoms [0,255,0]
  138. select (atomno>=511) and (atomno<=521)
  139. colour atoms [150,150,150]
  140. select (atomno>=522) and (atomno<=532)
  141. colour atoms [0,255,0]
  142. select (atomno>=533) and (atomno<=543)
  143. colour atoms [150,150,150]
  144. select (atomno>=544) and (atomno<=553)
  145. colour atoms [0,0,255]
  146. select (atomno>=554) and (atomno<=564)
  147. colour atoms [150,150,150]
  148. select (atomno>=565) and (atomno<=572)
  149. colour atoms [255,0,0]
  150. select (atomno>=573) and (atomno<=583)
  151. colour atoms [150,150,150]
  152. select (atomno>=584) and (atomno<=592)
  153. colour atoms [255,255,0]
  154. select (atomno>=593) and (atomno<=603)
  155. colour atoms [150,150,150]
  156. select (atomno>=604) and (atomno<=614)
  157. colour atoms [0,255,0]
  158. select (atomno>=615) and (atomno<=625)
  159. colour atoms [150,150,150]
  160. select (atomno>=626) and (atomno<=634)
  161. colour atoms [255,255,0]
  162. select (atomno>=635) and (atomno<=645)
  163. colour atoms [150,150,150]
  164. select (atomno>=646) and (atomno<=653)
  165. colour atoms [255,0,0]
  166. select (atomno>=654) and (atomno<=664)
  167. colour atoms [150,150,150]
  168. select (atomno>=665) and (atomno<=672)
  169. colour atoms [255,0,0]
  170. select (atomno>=673) and (atomno<=683)
  171. colour atoms [150,150,150]
  172. select (atomno>=684) and (atomno<=692)
  173. colour atoms [255,255,0]
  174. select (atomno>=693) and (atomno<=703)
  175. colour atoms [150,150,150]
  176. select (atomno>=704) and (atomno<=711)
  177. colour atoms [255,0,0]
  178. select (atomno>=712) and (atomno<=722)
  179. colour atoms [150,150,150]
  180. select (atomno>=723) and (atomno<=730)
  181. colour atoms [255,0,0]
  182. select (atomno>=731) and (atomno<=741)
  183. colour atoms [150,150,150]
  184. select (atomno>=742) and (atomno<=752)
  185. colour atoms [0,255,0]
  186. select (atomno>=753) and (atomno<=763)
  187. colour atoms [150,150,150]
  188. select (atomno>=764) and (atomno<=774)
  189. colour atoms [0,255,0]
  190. select (atomno>=776) and (atomno<=1766)
  191. colour atoms cpk
  192. select all
  193. spacefill off
  194.  
  195. # Bonds
  196. wireframe off
  197. select (atomno=774) or (atomno==764)
  198. wireframe on
  199. select (atomno=774) or (atomno==767)
  200. wireframe on
  201. select (atomno=774) or (atomno==773)
  202. wireframe on
  203. select (atomno=773) or (atomno==771)
  204. wireframe on
  205. select (atomno=772) or (atomno==771)
  206. wireframe on
  207. select (atomno=771) or (atomno==770)
  208. wireframe on
  209. select (atomno=770) or (atomno==768)
  210. wireframe on
  211. select (atomno=769) or (atomno==768)
  212. wireframe on
  213. select (atomno=768) or (atomno==767)
  214. wireframe on
  215. select (atomno=767) or (atomno==766)
  216. wireframe on
  217. select (atomno=766) or (atomno==765)
  218. wireframe on
  219. select (atomno=765) or (atomno==764)
  220. wireframe on
  221. select (atomno=764) or (atomno==763)
  222. wireframe on
  223. select (atomno=763) or (atomno==759)
  224. wireframe on
  225. select (atomno=763) or (atomno==762)
  226. wireframe on
  227. select (atomno=762) or (atomno==760)
  228. wireframe on
  229. select (atomno=761) or (atomno==760)
  230. wireframe on
  231. select (atomno=760) or (atomno==758)
  232. wireframe on
  233. select (atomno=759) or (atomno==758)
  234. wireframe on
  235. select (atomno=758) or (atomno==757)
  236. wireframe on
  237. select (atomno=757) or (atomno==756)
  238. wireframe on
  239. select (atomno=756) or (atomno==753)
  240. wireframe on
  241. select (atomno=755) or (atomno==753)
  242. wireframe on
  243. select (atomno=754) or (atomno==753)
  244. wireframe on
  245. select (atomno=753) or (atomno==739)
  246. wireframe on
  247. select (atomno=752) or (atomno==742)
  248. wireframe on
  249. select (atomno=752) or (atomno==745)
  250. wireframe on
  251. select (atomno=752) or (atomno==751)
  252. wireframe on
  253. select (atomno=751) or (atomno==749)
  254. wireframe on
  255. select (atomno=750) or (atomno==749)
  256. wireframe on
  257. select (atomno=749) or (atomno==748)
  258. wireframe on
  259. select (atomno=748) or (atomno==746)
  260. wireframe on
  261. select (atomno=747) or (atomno==746)
  262. wireframe on
  263. select (atomno=746) or (atomno==745)
  264. wireframe on
  265. select (atomno=745) or (atomno==744)
  266. wireframe on
  267. select (atomno=744) or (atomno==743)
  268. wireframe on
  269. select (atomno=743) or (atomno==742)
  270. wireframe on
  271. select (atomno=742) or (atomno==741)
  272. wireframe on
  273. select (atomno=741) or (atomno==737)
  274. wireframe on
  275. select (atomno=741) or (atomno==740)
  276. wireframe on
  277. select (atomno=740) or (atomno==738)
  278. wireframe on
  279. select (atomno=739) or (atomno==738)
  280. wireframe on
  281. select (atomno=738) or (atomno==736)
  282. wireframe on
  283. select (atomno=737) or (atomno==736)
  284. wireframe on
  285. select (atomno=736) or (atomno==735)
  286. wireframe on
  287. select (atomno=735) or (atomno==734)
  288. wireframe on
  289. select (atomno=734) or (atomno==731)
  290. wireframe on
  291. select (atomno=733) or (atomno==731)
  292. wireframe on
  293. select (atomno=732) or (atomno==731)
  294. wireframe on