home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9601.ZIP / M9610319.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-01-30  |  3KB  |  51 lines
  1.        Document 0319
  2.  DOCN  M9610319
  3.  TI    The amino terminal domain of HIV-1 Rev is required for discrimination of
  4.        the RRE from nonspecific RNA.
  5.  DT    9601
  6.  AU    Daly TJ; Doten RC; Rusche JR; Auer M; Repligen Corporation, Cambridge,
  7.        MA 02139, USA.
  8.  SO    J Mol Biol. 1995 Oct 20;253(2):243-58. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        MED/96036758
  10.  AB    The ability of HIV-1 Rev to successfully discriminate between specific
  11.        Rev-responsive elements (RRE) and nonspecific binding sites in the
  12.        presence of excess nonspecific RNA was examined using filter binding,
  13.        gel shift, and gel filtration techniques, using purified M4 Rev mutant
  14.        protein and endoproteinase Lys-C cleaved wild-type Rev. The M4 Rev
  15.        displayed a slightly reduced binding affinity to the RRE, as well as a
  16.        tenfold decrease in its ability to discriminate the RRE from
  17.        non-specific RNA compared to the wild-type Rev. Gel shift and gel
  18.        filtration chromotography data also showed decreased ability of the
  19.        mutant to multimerize in the absence or presence of the RRE. The Lys-C
  20.        cleaved Rev, which lacks the amino-terminal 20 amino acids of the
  21.        protein, displayed less ability to discriminate the RRE from nonspecific
  22.        RNA compared to either the wild-type or the M4 mutant Rev and appeared
  23.        unable to form protein-protein interactions, yet still bound sense and
  24.        antisense RNA species with high affinity (Kd was in the nanomolar
  25.        concentration range). A 40 amino acid peptide containing the
  26.        arginine-rich RRE binding domain of Rev was also observed to interact
  27.        with both the RRE and antisense RNA fragments with a binding constant of
  28.        about 1 x 10(-9) M. However, the peptide displayed almost no ability to
  29.        discriminate between the RRE and a comparably sized antisense RRE. The
  30.        loss in ability to discriminate correct from incorrect binding sites
  31.        correlates with overall decreases in the alpha-helical character of the
  32.        protein and perturbations within the amino terminus. The amino terminus
  33.        of Rev is likely to maintain the conformational integrity of the
  34.        arginine rich RRE binding domain which is required for specific RNA
  35.        binding site discrimination or stabilization of specific Rev-RRE
  36.        interactions.
  37.  DE    Amino Acid Sequence  Base Sequence  Binding Sites  Binding, Competitive
  38.        Circular Dichroism  Cloning, Molecular  Comparative Study  Escherichia
  39.        coli  Gene Products, rev/*CHEMISTRY/ISOLATION & PURIF/*METABOLISM
  40.        HIV-1/*METABOLISM  Kinetics  Macromolecular Systems  Mathematics
  41.        Models, Structural  Models, Theoretical  Molecular Sequence Data
  42.        *Nucleic Acid Conformation  Peptide Fragments/CHEMISTRY/CHEMICAL
  43.        SYNTHESIS  Recombinant Proteins/CHEMISTRY/ISOLATION & PURIF/METABOLISM
  44.        RNA, Antisense/*CHEMISTRY/ISOLATION & PURIF/METABOLISM  RNA,
  45.        Viral/*CHEMISTRY/ISOLATION & PURIF/METABOLISM  Substrate Specificity
  46.        JOURNAL ARTICLE
  47.  
  48.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  49.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  50.  
  51.