home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9601.ZIP / M9610354.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-01-30  |  2KB  |  27 lines
  1.        Document 0354
  2.  DOCN  M9610354
  3.  TI    BUILDER v.2: improving the chemistry of a de novo design strategy.
  4.  DT    9601
  5.  AU    Roe DC; Kuntz ID; Department of Pharmaceutical Chemistry, University of
  6.        California,; San Francisco 94143-0446, USA.
  7.  SO    J Comput Aided Mol Des. 1995 Jun;9(3):269-82. Unique Identifier :
  8.        AIDSLINE MED/96044961
  9.  AB    Significant improvements have been made to the de novo drug design
  10.        program BUILDER. The BUILDER strategy is to find molecule templates that
  11.        bind tightly to 'hot spots' in the target receptor, and then generate
  12.        bridges to join these templates. In this paper, the bridging algorithm
  13.        has been further developed to improve the chemical sense and diversity
  14.        of the bridges, as well as the robustness of the technique. The improved
  15.        algorithm is then applied to rebuild known bridges in methotrexate and
  16.        HIV protease. Finally, the entire BUILDER approach is tested by
  17.        rebuilding methotrexate de novo.
  18.  DE    Algorithms  Binding Sites  Comparative Study  Databases, Factual  *Drug
  19.        Design  Evaluation Studies  HIV Protease Inhibitors/CHEMISTRY
  20.        Methotrexate/CHEMISTRY  Models, Chemical  Molecular Structure  *Software
  21.        Sugar Alcohols/CHEMISTRY  Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Valine/ANALOGS &
  22.        DERIVATIVES/CHEMISTRY  JOURNAL ARTICLE
  23.  
  24.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  25.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  26.  
  27.