home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9601.ZIP / M9610356.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-01-30  |  2KB  |  37 lines
  1.        Document 0356
  2.  DOCN  M9610356
  3.  TI    PRO_LIGAND: an approach to de novo molecular design. 4. Application to
  4.        the design of peptides.
  5.  DT    9601
  6.  AU    Frenkel D; Clark DE; Li J; Murray CW; RObson B; Waszkowycz B; Westhead
  7.        DR; Proteus Molecular Design Ltd., Macclesfield, Cheshire, U.K.
  8.  SO    J Comput Aided Mol Des. 1995 Jun;9(3):213-25. Unique Identifier :
  9.        AIDSLINE MED/96044957
  10.  AB    In some instances, peptides can play an important role in the discovery
  11.        of lead compounds. This paper describes the peptide design facility of
  12.        the de novo drug design package, PRO_LIGAND. The package provides a
  13.        unified framework for the design of peptides that are similar or
  14.        complementary to a specified target. The approach uses single amino acid
  15.        residues, selected from preconstructed libraries of different residues
  16.        and conformations, and places them on top of predefined target
  17.        interaction sites. This approach is a well-tested methodology for the
  18.        design of organics but has not been used for peptides before. Peptides
  19.        represent a difficulty because of their great conformational flexibility
  20.        and a study of the advantages and disadvantages of this simple approach
  21.        is an important step in the development of design tools. After a
  22.        description of our general approach, a more detailed discussion of its
  23.        adaptation to peptides is given. The method is then applied to the
  24.        design of peptide-based inhibitors to HIV-1 protease and the design of
  25.        structural mimics of the surface region of lysozyme. The results are
  26.        encouraging and point the way towards further development of interaction
  27.        site-based approaches for peptide design.
  28.  DE    Amino Acid Sequence  Binding Sites  *Drug Design
  29.        Epitopes/CHEMISTRY/GENETICS  HIV Protease/CHEMISTRY  HIV Protease
  30.        Inhibitors/CHEMISTRY  HIV-1/DRUG EFFECTS/ENZYMOLOGY  Models, Molecular
  31.        Molecular Sequence Data  Muramidase/CHEMISTRY/GENETICS/IMMUNOLOGY
  32.        Peptides/*CHEMISTRY  Protein Conformation  *Software  JOURNAL ARTICLE
  33.  
  34.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  35.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  36.  
  37.