home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9601.ZIP / M9610453.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-01-30  |  3KB  |  45 lines
  1.        Document 0453
  2.  DOCN  M9610453
  3.  TI    Structural requirements for the binding of tRNA Lys3 to reverse
  4.        transcriptase of the human immunodeficiency virus type 1.
  5.  DT    9601
  6.  AU    Oude Essink BB; Das AT; Berkhout B; Department of Virology, Academic
  7.        Medical Center, University of; Amsterdam, The Netherlands.
  8.  SO    J Biol Chem. 1995 Oct 6;270(40):23867-74. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        MED/96007545
  10.  AB    Reverse transcription of the human immunodeficiency virus type 1 (HIV-1)
  11.        RNA genome is primed by the cellular tRNA Lys3 molecule. Packaging of
  12.        this tRNA primer during virion assembly is thought to be mediated by
  13.        specific interactions with the reverse transcriptase (RT) protein.
  14.        Portions of the tRNA molecule that are required for interaction with the
  15.        RT protein remain poorly defined. We have used an RNA gel mobility shift
  16.        assay to measure the in vitro binding of purified RT to mutant forms of
  17.        tRNA Lys3. The anticodon loop could be mutated without eliminating RT
  18.        recognition. However, mutations in the T psi C stem were found to
  19.        partially interfere with RT binding, and D arm mutants were completely
  20.        inactive in RT binding. Interestingly, binding of the RT protein to tRNA
  21.        Lys3 facilitates the subsequent annealing of template strand to the
  22.        3'-terminus of the tRNA molecule. Consistent with this finding, we
  23.        demonstrate that mutant HIV-1 virions lacking the RT protein do contain
  24.        a viral RNA genome without an associated tRNA Lys3 primer. We also found
  25.        that a preformed primer tRNA-template complex is efficiently recognized
  26.        by RT protein in vitro. Extension of the template molecule over the T
  27.        psi C loop did result in complete inhibition of RT binding, suggesting
  28.        the presence of additional recognition elements in the T psi C loop.
  29.        These results, combined with a comparative sequence analysis of tRNA
  30.        species present in HIV-1 virions and RNA motifs selected in vitro for
  31.        high affinity RT binding, suggest that RT recognizes the central domain
  32.        of the tRNA tertiary structure, which is formed by interaction of the D
  33.        and T psi C loops.
  34.  DE    Base Sequence  Binding Sites  DNA Primers/GENETICS  Human
  35.        HIV-1/*ENZYMOLOGY  In Vitro  Molecular Sequence Data  Molecular
  36.        Structure  Mutagenesis, Site-Directed  Nucleic Acid Conformation
  37.        RNA-Directed DNA Polymerase/*METABOLISM  RNA, Transfer,
  38.        Lys/*CHEMISTRY/GENETICS/*METABOLISM  RNA,
  39.        Viral/CHEMISTRY/GENETICS/METABOLISM  Support, Non-U.S. Gov't  JOURNAL
  40.        ARTICLE
  41.  
  42.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  43.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  44.  
  45.