home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9602.ZIP / M9620252.TXT < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1996-02-27  |  2.4 KB  |  40 lines
  1.        Document 0252
  2.  DOCN  M9620252
  3.  TI    The orientation of binding of human immunodeficiency virus reverse
  4.        transcriptase on nucleic acid hybrids.
  5.  DT    9602
  6.  AU    DeStefano JJ; Department of Microbiology, University of Maryland,
  7.        College Park; 20742, USA.
  8.  SO    Nucleic Acids Res. 1995 Oct 11;23(19):3901-8. Unique Identifier :
  9.        AIDSLINE MED/96038846
  10.  AB    The binding of HIV reverse transcriptase (RT) to heteroduplexes was
  11.        examined using a substrate consisting of a 42 nt chimeric nucleic acid
  12.        composed. (5'-->3') of 23 nt of RNA and 19 of DNA. This chimera was
  13.        hybridized to an internal region of a relatively long complementary DNA
  14.        or RNA. When the chimera was bound to DNA and conditions limiting
  15.        cleavage to a single binding event between the enzyme and substrate were
  16.        employed initial RNase H-directed cleavages occurred 19-21 nt from the
  17.        chimera 5'-terminus. A 42 nt strand identical in sequence to the chimera
  18.        and composed of only RNA was cleaved at the same locations. Reducing the
  19.        length of the DNA portion of the chimera from 19 to 7 nt did not alter
  20.        the cleavage positions, suggesting that cleavage was not coordinated by
  21.        the DNA 3'-terminus. Under the same conditions cleavage was not detected
  22.        when the chimera was bound to RNA. In contrast, addition of dNTPs to the
  23.        DNA 3'-terminus of the chimera occurred only when the chimera was bound
  24.        to RNA. The results support preferable binding of RT to RNA-DNA versus
  25.        DNA-DNA hybrid regions and a model in which the orientation of binding
  26.        to heteroduplexes is 5'-->3' (relative to the RNA strand), polymerase to
  27.        RNase H active site, with sites associated with the DNA and RNA strand
  28.        respectively.
  29.  DE    Base Sequence  Binding Sites  DNA, Complementary/CHEMISTRY/METABOLISM
  30.        Heparin/PHARMACOLOGY  HIV/*ENZYMOLOGY  Molecular Sequence Data  Nucleic
  31.        Acid Heteroduplexes/CHEMISTRY/*METABOLISM  Nucleic Acid Hybridization
  32.        Recombinant Proteins/METABOLISM  Ribonuclease H, Calf Thymus/METABOLISM
  33.        RNA-Directed DNA Polymerase/*METABOLISM  RNA,
  34.        Complementary/CHEMISTRY/METABOLISM  Structure-Activity Relationship
  35.        Support, U.S. Gov't, P.H.S.  JOURNAL ARTICLE
  36.  
  37.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  38.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  39.  
  40.