home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9602.ZIP / M9620661.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-02-26  |  3KB  |  42 lines
  1.        Document 0661
  2.  DOCN  M9620661
  3.  TI    A single amino acid in the SH3 domain of Hck determines its high
  4.        affinity and specificity in binding to HIV-1 Nef protein.
  5.  DT    9602
  6.  AU    Lee CH; Leung B; Lemmon MA; Zheng J; Cowburn D; Kuriyan J; Saksela K;
  7.        Laboratory of Molecular Biophysics, Rockefeller University, New; York,
  8.        NY 10021, USA.
  9.  SO    EMBO J. 1995 Oct 16;14(20):5006-15. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/96067129
  11.  AB    We have examined the differential binding of Hck and Fyn to HIV-1 Nef to
  12.        elucidate the structural basis of SH3 binding affinity and specificity.
  13.        Full-length Nef bound to Hck SH3 with the highest affinity reported for
  14.        an SH3-mediated interaction (KD 250 nM). In contrast to Hck, affinity of
  15.        the highly homologous Fyn SH3 for Nef was too weak (KD > 20 microM) to
  16.        be accurately determined. We show that this distinct specificity lies in
  17.        a variable loop, the 'RT loop', positioned close to conserved SH3
  18.        residues implicated in the binding of proline-rich (PxxP) motifs. A
  19.        mutant Fyn SH3 with a single amino acid substitution (R96I) in its RT
  20.        loop had an affinity (KD 380 nM) for Nef comparable with that of Hck
  21.        SH3. Based on additional mutagenesis studies we propose that the
  22.        selective recognition of Nef by Hck SH3 is determined by hydrophobic
  23.        interactions involving an isoleucine residue in its RT loop. Although
  24.        Nef contains a PxxP motif which is necessary for the interaction with
  25.        Hck SH3, high affinity binding was only observed for intact Nef protein.
  26.        The binding of a peptide containing the Nef PxxP motif showed > 300-fold
  27.        weaker affinity for Hck SH3 than full-length Nef.
  28.  DE    *src Homology Domains  Amino Acid Sequence  Biosensors  Calorimetry
  29.        Circular Dichroism  Comparative Study  Gene Products,
  30.        nef/GENETICS/*METABOLISM  HIV-1/GENETICS/*METABOLISM  Models, Molecular
  31.        Molecular Sequence Data  Oligopeptides/CHEMICAL SYNTHESIS  Precipitation
  32.        Protein Binding  Protein Conformation  Protein-Tyrosine
  33.        Kinase/GENETICS/*METABOLISM  Proto-Oncogene
  34.        Proteins/GENETICS/*METABOLISM  Recombinant Proteins/METABOLISM  Sequence
  35.        Homology, Amino Acid  Spectrometry, Fluorescence  Structure-Activity
  36.        Relationship  Support, Non-U.S. Gov't  Support, U.S. Gov't, P.H.S.  Time
  37.        Factors  JOURNAL ARTICLE
  38.  
  39.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  40.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  41.  
  42.