home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / SCIENCE / GEP202C.ZIP / README.TXT < prev    next >
Text File  |  1992-11-18  |  2KB  |  40 lines
  1. This is GEPASI 2.0, a general purpose simulator of metabolic pathways.
  2. It is a directed towards research and education; it is meant to be a
  3. very useful tool for modelling biochemical pathways, chemical 
  4. reactions,etc. GEPASI is free software covered by the GNU general
  5. public license, version 1.
  6.  
  7. This version of GEPASI runs under MS-Windows 3.1 in 386 enhanced mode, 
  8. on 80386SX and above microprocessors. A maths co-processor is not 
  9. needed but should accelerate the simulations by at least a factor of
  10. 10.
  11.  
  12. To install GEPASI unzip all the files to a diskette or to a hard-disk 
  13. directory; there is no need to do this if you have received GEPASI in
  14. a diskette. Next go to Windows' program manager, select File-Run, and
  15. enter SETUP.EXE (don't forget to include the complete path of the
  16. disk drive and directory where you have unzipped it to).
  17.  
  18. In order to simulate bichemical pathways, the user must first define
  19. the reactions that are part of the pathway, all its parameters and 
  20. initial concentrations of the metabolites (chemical species). GEPASI
  21. then determines the dynamics and steady state (if there is one),
  22. including the coefficients defined in Metabolic Control Analysis.
  23. GEPASI can be used to study metabolic regulation, chemical and enzyme
  24. kinetics including oscillatory (limit cycle) and chaotic reactions.
  25.  
  26. The file GEPASI.WRI contains a cut-down version of a paper to appear
  27. in "Modern trends in Biothermokinetics", edited by J.-P. Mazat, S.
  28. Schuster and M. Rigoulet and published by Plenum Press with a short
  29. description of GEPASI. Another more detailed paper is being submitted 
  30. to the journal "Computer Applications in the Biosciences".
  31.  
  32. For more detailed information see the help file (GEPASI.HLP). The 
  33. subjects of metabolic simulation and metabolic control analysis are 
  34. discussed in the mailing list btk-mca. To subscribe to this list send 
  35. a mail message to biosci@net.bio.net, post to the list to 
  36. btk-mca@net.bio.net.
  37.  
  38. GEPASI 2.0 (c) 1898,1992 by Pedro Mendes.
  39. prm@aber.ac.uk
  40.