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/ The Datafile PD-CD 5 / DATAFILE_PDCD5.iso / rasmol / scipts / dna3 / !DNA3 / DNA3AA_SCR < prev    next >
Text File  |  1996-04-12  |  2KB  |  109 lines
  1. zap
  2. set hourglass on
  3. load "atp.pdb"
  4.  
  5. script resetatp.scr
  6. restrict atomno>=22 and atomno <=31
  7. select selected or (atomno>=36 and atomno <=37)
  8. select selected or (atomno>=42 and atomno <=43)
  9. define t_base selected
  10. wireframe 0.4
  11. center selected
  12. script clrleg.scr
  13. echo DNA (deoxyribose nucleic acid) is made up of 4 nucleotides,
  14. echo A, T, G, and C.  Each nucleotide includes one purine or
  15. echo pyrimidine base.  Here is ADENINE.
  16. echo
  17. echo Carbon=GRAY, Oxygen=RED, Nitrogen=BLUE, Hydrogen=WHITE.
  18. pause
  19. script wave.scr
  20. pause
  21.  
  22. script cpkdark.scr
  23.  
  24. script resetatp.scr
  25. select atomno>=1 and atomno <=9
  26. select selected or (atomno>=32 and atomno <=35)
  27. select selected or (atomno>=38 and atomno <=41)
  28. select selected or atomno=22
  29. define drib selected
  30. wireframe 0.4
  31. center selected
  32. echo The base is connected to DEOXYRIBOSE.
  33. script rna2dna.scr
  34. script wave.scr
  35. pause
  36.  
  37. select t_base or drib
  38. script cpkdark.scr
  39. script rna2dna.scr
  40. echo
  41. echo RNA nucleotides are built with RIBOSE instead of DEOXYRIBOSE.
  42. echo Ribose has one additional oxygen.
  43. pause
  44.  
  45. script dna2rna.scr
  46. refresh
  47. script delay1.scr
  48.  
  49. script rna2dna.scr
  50. refresh
  51. script delay1.scr
  52.  
  53. script dna2rna.scr
  54. refresh
  55. script delay1.scr
  56.  
  57. script rna2dna.scr
  58. refresh
  59. script delay1.scr
  60.  
  61. script dna2rna.scr
  62. refresh
  63. script delay1.scr
  64.  
  65. script dna2rna.scr
  66. refresh
  67. script delay1.scr
  68.  
  69. script rna2dna.scr
  70. refresh
  71. script delay1.scr
  72. pause
  73.  
  74. script resetatp.scr
  75. script cpkdark.scr
  76. script rna2dnad.scr
  77. select atomno>=9 and atomno <=11
  78. select selected or (atomno>=20 and atomno <=22)
  79. wireframe 0.4
  80. script clrleg.scr
  81. echo Phosphorylation of a nucleoside makes a nucleotide.
  82. echo Here is DEOXY ADENOSINE MONOPHOSPHATE.
  83. echo This is the modular unit from which DNA is constructed.
  84. echo The phosphates chain together, forming the DNA double helix backbone.
  85. script wave.scr
  86. pause
  87.  
  88. script resetatp.scr
  89. script cpkdark.scr
  90. select atomno>=11 and atomno <=13
  91. select selected or (atomno>=18 and atomno <=19)
  92. wireframe 0.4
  93. script clrleg.scr
  94. echo Here is deoxy adenosine DIphosphate.
  95. script wave.scr
  96. pause
  97.  
  98. script resetatp.scr
  99. select all
  100. color cpk
  101. wireframe 0.4
  102. script rna2dna.scr
  103. script clrleg.scr
  104. echo Here is deoxy adenosine TRIphosphate.
  105. echo This is the high-energy form which DNA polymerase can use
  106. echo to replicate DNA.
  107. script wave.scr
  108. pause
  109.