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Text File  |  1996-02-25  |  1KB  |  57 lines
  1. zap
  2. load "2hhd.pdb"
  3. wireframe off
  4.  
  5. select protein
  6. spacefill
  7. color chain
  8.  
  9. select hem
  10. spacefill
  11. color red
  12.  
  13. #there are two sulfates and many waters not shown
  14.  
  15. select iron
  16. color cpk #orange
  17.  
  18. script clrleg.scr
  19. echo THE HEMOGLOBIN MOLECULE IS MADE UP OF FOUR POLYPEPTIDE CHAINS,
  20. echo NONCOVALENTLY BOUND TO EACH OTHER.  THERE ARE FOUR HEME GROUPS
  21. echo CONTAINING IRON (RED).
  22. pause
  23.  
  24. zoom 50
  25. script x90-3.scr
  26. pause
  27.  
  28. zoom 100
  29. pause
  30.  
  31. select protein
  32. spacefill off
  33. backbone 0.5
  34. script clrleg.scr
  35. echo EACH CHAIN HOLDS A HEME GROUP CONTAINING ONE Fe++ ATOM (ORANGE).
  36. echo THE HEMES ARE COLORED RED BECAUSE THEY GIVE HEMOGLOBIN ITS RED COLOR.
  37. pause
  38.  
  39. script y-90-3.scr
  40. pause
  41.  
  42. backbone off
  43. pause
  44.  
  45. select hem
  46. color cpk
  47. script clrleg.scr
  48. echo NOW THE HEMES HAVE BEEN COLORED BY ELEMENT:
  49. echo CARBON=GRAY, NITROGEN=BLUE, OXYGEN=RED, IRON=ORANGE.
  50. echo (HYDROGENS ARE NOT RESOLVED BY X-RAY CRYSTALLOGRAPHY,
  51. echo FROM WHICH THIS STRUCTURE WAS OBTAINED.)
  52. pause
  53.  
  54. script x90-2.scr
  55. pause
  56.  
  57.