home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9602.ZIP / M9620233.TXT < prev    next >
Encoding:
Text File  |  1996-02-27  |  2.5 KB  |  41 lines
  1.        Document 0233
  2.  DOCN  M9620233
  3.  TI    In vitro integration of human immunodeficiency virus type 1 cDNA into
  4.        targets containing protein-induced bends.
  5.  DT    9602
  6.  AU    Bor YC; Bushman FD; Orgel LE; Salk Institute for Biological Studies, San
  7.        Diego, CA 92186-8500,; USA.
  8.  SO    Proc Natl Acad Sci U S A. 1995 Oct 24;92(22):10334-8. Unique Identifier
  9.        : AIDSLINE MED/96036079
  10.  AB    Integration of human immunodeficiency virus type 1 cDNA into a target
  11.        DNA can be strongly influenced by the conformation of the target. For
  12.        example, integration in vitro is sometimes favored in target DNAs
  13.        containing sequence-directed bends or DNA distortions caused by bound
  14.        proteins. We have analyzed the effect of DNA bending by studying
  15.        integration into two well-characterized protein-DNA complexes:
  16.        Escherichia coli integration host factor (IHF) protein bound to a phage
  17.        IHF site, and the DNA binding domain of human lymphoid enhancer factor
  18.        (LEF) bound to a LEF site. Both of these proteins have previously been
  19.        reported to bend DNA by approximately 140 degrees. Binding of IHF
  20.        greatly increases the efficiency of in vitro integration at hotspots
  21.        within the IHF site. We analyzed a series of mutants in which the IHF
  22.        site was modified at the most prominent hotspot. We found that each
  23.        variant still displayed enhanced integration upon IHF binding. Evidently
  24.        the local sequence is not critical for formation of an IHF hotspot. LEF
  25.        binding did not create preferred sites for integration. The different
  26.        effects of IHF and LEF binding can be rationalized in terms of the
  27.        different proposed conformations of the two protein-DNA complexes.
  28.  DE    Bacterial Proteins/CHEMISTRY/*METABOLISM  Base Sequence  Comparative
  29.        Study  DNA Nucleotidyltransferases/BIOSYNTHESIS/*METABOLISM  DNA Primers
  30.        DNA-Binding Proteins/METABOLISM  DNA,
  31.        Complementary/CHEMISTRY/*METABOLISM  DNA, Viral/CHEMISTRY/*METABOLISM
  32.        Human  HIV-1/*GENETICS/METABOLISM  Models, Structural  Molecular
  33.        Sequence Data  Nucleic Acid Conformation  Polymerase Chain Reaction
  34.        Protein Conformation  Recombinant
  35.        Proteins/BIOSYNTHESIS/CHEMISTRY/METABOLISM  Support, U.S. Gov't, P.H.S.
  36.        *Virus Integration  JOURNAL ARTICLE
  37.  
  38.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  39.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  40.  
  41.