home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9602.ZIP / M9621034.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-02-26  |  3KB  |  48 lines
  1.        Document 1034
  2.  DOCN  M9621034
  3.  TI    Seroreactivity of analogous antigenic epitopes in glycoprotein 120
  4.        expressed in HIV-1 subtypes A, B, C, and D.
  5.  DT    9602
  6.  AU    Pestano GA; Hosford KS; Spira AI; Riley J; Xie JM; Sewankambo N; Brown
  7.        L; Ho DD; Boto WM; Department of Biology, City College of the City
  8.        University of New; York, New York 10031, USA.
  9.  SO    AIDS Res Hum Retroviruses. 1995 May;11(5):589-96. Unique Identifier :
  10.        AIDSLINE MED/96093894
  11.  AB    This article describes the impact of sequence variation on the
  12.        distribution and seroreactivity of linear antigenic epitopes in gp120
  13.        encoded in new Ugandan HIV-1 clones from subtypes A, C, and D, and in
  14.        North American clones from the B subtype. A region of the env gene
  15.        encoding the C2 to V5 domains was PCR amplified from the lysates of
  16.        peripheral blood leukocytes or from short-term cultured isolates.
  17.        Computer-assisted analyses were conducted on the amino acid sequences to
  18.        determine the distribution of surface structures in gp120. Despite
  19.        marked sequence diversity, eight analogous epitopes were predicted for
  20.        all clades of the virus analyzed. Synthetic peptides comprising the
  21.        putative principal neutralizing determinant E2[V3], and other B cell
  22.        epitopes E3[V3-V4], E4[V3-V4], E7[C3], and E8[V5], from a seroprevalent
  23.        Ugandan isolate, AUG06c, were tested in ELISA for antigenicity with sera
  24.        from Uganda, New York, and Thailand. Variable magnitudes of
  25.        seroreactivity were observed for all of the peptides tested. However, a
  26.        significantly higher degree of serum cross-reactivity was detected with
  27.        the V3 loop peptide. ELISA reactivities of the same serum panel
  28.        indicated that V3 loop peptides containing the apical residues GPGR
  29.        (clones AUG06c and BRT3) or GPGQ (CUG045 and DUG044) were more antigenic
  30.        and display extensive cross-reactivity as compared to analogous peptides
  31.        comprising GLGQ (DUG23c), GQGQ (DUG042), or GPWG (BRT1). BETATURN
  32.        analysis of the divergent V3 loop apical residues showed a good
  33.        correlation of probable beta-turn occurrence with strong seroreactivity.
  34.        These findings suggest that the major antigenic specificities in the
  35.        divergent clades of HIV-1 are well conserved.(ABSTRACT TRUNCATED AT 250
  36.        WORDS)
  37.  DE    Amino Acid Sequence  Antigenic Variation  Epitopes/GENETICS/*IMMUNOLOGY
  38.        Genes, env  Human  HIV Antigens/GENETICS/*IMMUNOLOGY  HIV Envelope
  39.        Protein gp120/GENETICS/*IMMUNOLOGY  HIV Seropositivity/BLOOD/VIROLOGY
  40.        HIV-1/CLASSIFICATION/GENETICS/*IMMUNOLOGY  Molecular Sequence Data  New
  41.        York  Peptide Fragments/IMMUNOLOGY  Sequence Homology, Amino Acid
  42.        Support, Non-U.S. Gov't  Support, U.S. Gov't, Non-P.H.S.  Support, U.S.
  43.        Gov't, P.H.S.  Thailand  Uganda  JOURNAL ARTICLE
  44.  
  45.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  46.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  47.  
  48.