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Text File  |  1996-02-26  |  2KB  |  40 lines
  1.        Document 0117
  2.  DOCN  M9620117
  3.  TI    Genotypic characteristics of HTLV-II isolates from Amerindian and
  4.        non-Indian populations.
  5.  DT    9602
  6.  AU    Pardi D; Hjelle B; Folks TM; Lal RB; Retrovirus Diseases Branch, Centers
  7.        for Disease Control and; Prevention, Atlanta, Georgia 30333, USA.
  8.  SO    Virus Genes. 1995;10(1):27-35. Unique Identifier : AIDSLINE
  9.        GENBANK/L11456
  10.  AB    The Amerindian human T-cell lymphotropic virus type II isolate
  11.        HTLV-IIG12 has been demonstrated to be an HTLV-IIb with several unique
  12.        features, including several restriction enzyme site changes, a
  13.        distinctive pre-gag region, a stop codon within the pol gene, and an
  14.        extended Tax protein. In this study, HTLV-II isolates from Amerindian
  15.        and non-Indian populations were characterized by restriction enzyme site
  16.        analysis to determine the prevalent HTLV-II subtype. In addition, DNA
  17.        amplification by the polymerase chain reaction and Southern blot
  18.        analyses were used to probe for the HTLV-IIG12 pre-gag region. Our
  19.        results showed that of 13 Guaymi Indian isolates subtyped, all were
  20.        HTLV-IIb, and that approximately one third of 17 isolates had the unique
  21.        pre-gag region. While other HTLV-II-infected groups contained both
  22.        HTLV-IIa and HTLV-IIb isolates, none of these isolates showed evidence
  23.        of the distinctive HTLV-IIG12 pre-gag region. Lastly, DNA sequence
  24.        analysis was used to determine the prevalence of the stop codon within
  25.        the pol gene open reading frame. These analyses revealed that the
  26.        occurrence of a stop codon within this sequence appeared to be
  27.        characteristic of most HTLV-IIb subtypes. These results further our
  28.        understanding of the genetic variations and evolution of the HTLV-II
  29.        viruses within the endemically infected Amerindian populations, as well
  30.        as U.S. intravenous drug users and other non-Indian populations.
  31.  DE    Base Sequence  Genes, env  Genes, gag  Genes, pol  Genotype  Human
  32.        HTLV-II/*GENETICS/ISOLATION & PURIF  HTLV-II Infections/BLOOD/*VIROLOGY
  33.        *Indians, Central American  *Indians, North American  Molecular Sequence
  34.        Data  Protein Precursors/GENETICS  Sequence Homology, Nucleic Acid
  35.        Tumor Cells, Cultured  JOURNAL ARTICLE
  36.  
  37.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  38.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  39.  
  40.