home *** CD-ROM | disk | FTP | other *** search
/ Collection of Education / collectionofeducationcarat1997.iso / HEALTH / MED9602.ZIP / M9620118.TXT < prev    next >
Text File  |  1996-02-26  |  2KB  |  36 lines
  1.        Document 0118
  2.  DOCN  M9620118
  3.  TI    Recovery of virtually full-length HIV-1 provirus of diverse subtypes
  4.        from primary virus cultures using the polymerase chain reaction.
  5.  DT    9602
  6.  AU    Salminen MO; Koch C; Sanders-Buell E; Ehrenberg PK; Michael NL; Carr JK;
  7.        Burke DS; McCutchan FE; Henry M. Jackson Foundation for the Advancement
  8.        of Military; Medicine, Rockville, Maryland 20850, USA.
  9.  SO    Virology. 1995 Oct 20;213(1):80-6. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        GENBANK/M19921
  11.  AB    In the course of the global pandemic, the human immunodeficiency virus
  12.        type-1 (HIV-1) has established at least eight distinct genotypes in the
  13.        main (M), or prevalent, group of isolates, a variety of rare outlier
  14.        forms, and intergenotypic recombinants of group M viruses. This
  15.        genotypic diversity has been documented, for the most part, by
  16.        sequencing of subgenomic segments of the provirus. Using DNA from virus
  17.        cultures on peripheral blood mononuclear cells (PBMC) and recent
  18.        improvements of the PCR technique, we have amplified virtually
  19.        full-length HIV-1 genomes from genetic subtypes A through G of group M
  20.        viruses and molecularly cloned several of them. Resequencing of the
  21.        complete genome of a prototype strain after long PCR amplification and
  22.        cloning has established a PCR error rate of 0.14%. We also report the
  23.        first complete PCR-derived sequence of a U.S. clinical isolate of
  24.        genotype B expanded only in primary PBMC; this provirus harbors a
  25.        uniquely truncated V3 loop.
  26.  DE    Amino Acid Sequence  Base Sequence  Cloning, Molecular  DNA
  27.        Primers/CHEMISTRY  DNA, Viral/*ANALYSIS  Electrophoresis, Agar Gel
  28.        *Genes, Viral  Genotype  Human  HIV-1/*GENETICS/PHYSIOLOGY  Leukocytes,
  29.        Mononuclear/VIROLOGY  Molecular Sequence Data  Polymerase Chain
  30.        Reaction/*METHODS  Proviruses/*GENETICS/PHYSIOLOGY  Support, Non-U.S.
  31.        Gov't  Virus Cultivation  JOURNAL ARTICLE
  32.  
  33.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  34.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  35.  
  36.