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Text File  |  1996-02-27  |  2.7 KB  |  44 lines
  1.        Document 0983
  2.  DOCN  M9620983
  3.  TI    A trimeric subdomain of the simian immunodeficiency virus envelope
  4.        glycoprotein.
  5.  DT    9602
  6.  AU    Blacklow SC; Lu M; Kim PS; Howard Hughes Medical Institute, Whitehead
  7.        Institute for; Biomedical Research, Department of Biology,
  8.        Massachusetts; Institute of Technology, Cambridge 02142, USA.
  9.  SO    Biochemistry. 1995 Nov 21;34(46):14955-62. Unique Identifier : AIDSLINE
  10.        MED/96072732
  11.  AB    Previous attempts to define the oligomeric state of the HIV and SIV
  12.        envelope glycoproteins have yielded conflicting results. We have
  13.        produced in Escherichia coli a recombinant model for the ectodomain of
  14.        the SIV envelope protein gp41 and have identified a small, trimeric
  15.        subdomain by proteolytic digestion of this gp41 fragment. The subdomain
  16.        assembles from two peptide fragments, spanning residues 28-80 (N28-80)
  17.        and residues 107-149 (C107-149) of SIV gp41. Each of these peptides
  18.        contains a 4,3-hydrophobic repeat, the hallmark of coiled-coil
  19.        sequences. Upon mixing, the peptides form a highly helical, trimeric
  20.        complex [3(N+C)] that resists proteolysis and has a melting temperature
  21.        (Tm) above 90 degrees C in physiological buffer. The N- and C-terminal
  22.        fragments are antiparallel to each other in the complex, as judged by
  23.        the observation that digestion of a variant recombinant protein
  24.        truncated at the amino terminus yields a C-terminal fragment shortened
  25.        at its carboxy terminus. The N28-80 peptide contains more positions
  26.        within the heptad repeat than C107-149 that are predominantly
  27.        hydrophobic, suggesting that N28-80 is buried in the interior of the
  28.        complex. We propose that the complex consists of a parallel, trimeric
  29.        coiled-coil of the N-terminal peptide, encircled by three C-terminal
  30.        peptide helices arranged in an antiparallel fashion, and that this
  31.        complex forms a core within the gp41 extracellular domain.
  32.  DE    Amino Acid Sequence  Chromatography, High Pressure Liquid  Circular
  33.        Dichroism  Comparative Study  Heat  Hydrogen-Ion Concentration
  34.        HIV/CHEMISTRY  Macromolecular Systems  Membrane Glycoproteins/*CHEMISTRY
  35.        Molecular Sequence Data  Peptide Fragments/CHEMISTRY/METABOLISM  Protein
  36.        Folding  Protein Structure, Secondary  Recombinant Proteins/CHEMISTRY
  37.        Retroviridae Proteins/*CHEMISTRY  Serine Proteinases/METABOLISM
  38.        Support, Non-U.S. Gov't  SIV/*CHEMISTRY  Viral Envelope
  39.        Proteins/*CHEMISTRY  JOURNAL ARTICLE
  40.  
  41.        SOURCE: National Library of Medicine.  NOTICE: This material may be
  42.        protected by Copyright Law (Title 17, U.S.Code).
  43.  
  44.